中国公共卫生
中國公共衛生
중국공공위생
CHINA PUBLIC HEALTH
2007年
4期
406-408
,共3页
芮勇宇%阚飙%高守一%刘延清%祁国明
芮勇宇%闞飆%高守一%劉延清%祁國明
예용우%감표%고수일%류연청%기국명
霍乱弧菌%噬菌体%序列分析
霍亂弧菌%噬菌體%序列分析
곽란호균%서균체%서렬분석
目的 研究霍乱弧菌埃尔托型(EVC)新类型溶源性噬菌体(CTXψ)和核心区不含ctxAB基因的溶源性噬菌体(nct-CTXψ)基因组的结构.方法 采用基因扩增、测序及序列生物信息学等方法进行观察与分析.结果 在我国EVC中,存在仅携带古典型(class)nct-CTXψ、CTXψ或埃尔托型(ET)CTXψ基因组类型,并发现nct-CTXclassψ和CTXETψ共存、nct-CTXnewETψ和CTXclassψ共存的新类型.CTXψ和nct-CTXψ基因组zot基因3'末端,60bp序列中40%位点不同,推测的氨基酸序列中60%位点不同.class、ET和newET类型ig1、rstR和ig2基因序列同源性分别为77.0%～97.4%,10.4%～17.9%,9.6%～64.8%,RstR同源性9.2%～24.1%.CTXψ基因组均位于染色体TLC基因簇附近.上述不同类型EVC的tcpA、TcpA、ctxA、ctxB、CtxA和CtxB与GenBank中EVC和0139群产毒株的同源性分别＞99%,99%,99%,98%,98%和96%.结论 首次在EVC中发现nct-CTXclassψ和CTXETψ、nct-CTXnewETψ和CTXclassψ共存的新类型.
目的 研究霍亂弧菌埃爾託型(EVC)新類型溶源性噬菌體(CTXψ)和覈心區不含ctxAB基因的溶源性噬菌體(nct-CTXψ)基因組的結構.方法 採用基因擴增、測序及序列生物信息學等方法進行觀察與分析.結果 在我國EVC中,存在僅攜帶古典型(class)nct-CTXψ、CTXψ或埃爾託型(ET)CTXψ基因組類型,併髮現nct-CTXclassψ和CTXETψ共存、nct-CTXnewETψ和CTXclassψ共存的新類型.CTXψ和nct-CTXψ基因組zot基因3'末耑,60bp序列中40%位點不同,推測的氨基痠序列中60%位點不同.class、ET和newET類型ig1、rstR和ig2基因序列同源性分彆為77.0%～97.4%,10.4%～17.9%,9.6%～64.8%,RstR同源性9.2%～24.1%.CTXψ基因組均位于染色體TLC基因簇附近.上述不同類型EVC的tcpA、TcpA、ctxA、ctxB、CtxA和CtxB與GenBank中EVC和0139群產毒株的同源性分彆＞99%,99%,99%,98%,98%和96%.結論 首次在EVC中髮現nct-CTXclassψ和CTXETψ、nct-CTXnewETψ和CTXclassψ共存的新類型.
목적 연구곽란호균애이탁형(EVC)신류형용원성서균체(CTXψ)화핵심구불함ctxAB기인적용원성서균체(nct-CTXψ)기인조적결구.방법 채용기인확증、측서급서렬생물신식학등방법진행관찰여분석.결과 재아국EVC중,존재부휴대고전형(class)nct-CTXψ、CTXψ혹애이탁형(ET)CTXψ기인조류형,병발현nct-CTXclassψ화CTXETψ공존、nct-CTXnewETψ화CTXclassψ공존적신류형.CTXψ화nct-CTXψ기인조zot기인3'말단,60bp서렬중40%위점불동,추측적안기산서렬중60%위점불동.class、ET화newET류형ig1、rstR화ig2기인서렬동원성분별위77.0%～97.4%,10.4%～17.9%,9.6%～64.8%,RstR동원성9.2%～24.1%.CTXψ기인조균위우염색체TLC기인족부근.상술불동류형EVC적tcpA、TcpA、ctxA、ctxB、CtxA화CtxB여GenBank중EVC화0139군산독주적동원성분별＞99%,99%,99%,98%,98%화96%.결론 수차재EVC중발현nct-CTXclassψ화CTXETψ、nct-CTXnewETψ화CTXclassψ공존적신류형.
