植物病理学报
植物病理學報
식물병이학보
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA
2008年
5期
478-488
,共11页
徐晓忠%刘庆坡%樊龙江%周雪平
徐曉忠%劉慶坡%樊龍江%週雪平
서효충%류경파%번룡강%주설평
双生病毒%密码子用法%相对同义密码子使用频率%聚类分析%进化
雙生病毒%密碼子用法%相對同義密碼子使用頻率%聚類分析%進化
쌍생병독%밀마자용법%상대동의밀마자사용빈솔%취류분석%진화
对双生病毒编码基因的变异进行了密码子用法分析,推测双生病毒基因的表达水平普遍不高,而外壳蛋白基因的表达水平相对较高,它们在密码子第3位上偏好使用A或T.双生病毒的密码子用法主要受到突变偏好和翻译选择等因素的影响.双生病毒的密码子使用具有基因特异性和一定程度的寄主特异性.基于相对同义密码子使用频率的聚类分析可以很好反映侵染单子叶植物和双子叶植物双生病毒之间的差异,也在一定程度上反映出双生病毒之间的亲缘关系.
對雙生病毒編碼基因的變異進行瞭密碼子用法分析,推測雙生病毒基因的錶達水平普遍不高,而外殼蛋白基因的錶達水平相對較高,它們在密碼子第3位上偏好使用A或T.雙生病毒的密碼子用法主要受到突變偏好和翻譯選擇等因素的影響.雙生病毒的密碼子使用具有基因特異性和一定程度的寄主特異性.基于相對同義密碼子使用頻率的聚類分析可以很好反映侵染單子葉植物和雙子葉植物雙生病毒之間的差異,也在一定程度上反映齣雙生病毒之間的親緣關繫.
대쌍생병독편마기인적변이진행료밀마자용법분석,추측쌍생병독기인적표체수평보편불고,이외각단백기인적표체수평상대교고,타문재밀마자제3위상편호사용A혹T.쌍생병독적밀마자용법주요수도돌변편호화번역선택등인소적영향.쌍생병독적밀마자사용구유기인특이성화일정정도적기주특이성.기우상대동의밀마자사용빈솔적취류분석가이흔호반영침염단자협식물화쌍자협식물쌍생병독지간적차이,야재일정정도상반영출쌍생병독지간적친연관계.
