生物工程学报
生物工程學報
생물공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY
2007年
6期
1091-1096
,共6页
猪%SOCS-2%基因克隆%序列分析
豬%SOCS-2%基因剋隆%序列分析
저%SOCS-2%기인극륭%서렬분석
从中国地方猪品种八眉猪(BaMei)肾脏组织中提取总RNA,采用RT-PCB方法克隆了猪SOCS-2(suppressor of cytokine signaling-2,细胞因子信号转导抑制因子-2)基因的cDNA序列,经T/A克隆,插入到pMD19-T载体上,导入大肠杆菌DH-5α,阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,将测序结果与GenBank中已登录的人、大鼠和小鼠SOCS-2基因的序列进行同源性比较,利用生物信息学和分子生物学软件对猪SOCS-2基因编码的蛋白进行结构预测.结果表明:首次成功克隆了猪SOCS-2基因的cDNA序列(GenBank登录号为EF121242),其长度为822 bp,该基因ORF区核苷酸序列与其他物种相比同源性达到93%以上,氨基酸同源性则达到89%以上,生物信息学分析表明该蛋白分子量为22.25kD,等电点pI=8.30,包含199个氨基酸残基.该基因cDNA序列的克隆,有利于进一步研究SOCS-2调节机体发育的分子机理.
從中國地方豬品種八眉豬(BaMei)腎髒組織中提取總RNA,採用RT-PCB方法剋隆瞭豬SOCS-2(suppressor of cytokine signaling-2,細胞因子信號轉導抑製因子-2)基因的cDNA序列,經T/A剋隆,插入到pMD19-T載體上,導入大腸桿菌DH-5α,暘性剋隆經PCR鑒定後進行測序,將測序結果與GenBank中已登錄的人、大鼠和小鼠SOCS-2基因的序列進行同源性比較,利用生物信息學和分子生物學軟件對豬SOCS-2基因編碼的蛋白進行結構預測.結果錶明:首次成功剋隆瞭豬SOCS-2基因的cDNA序列(GenBank登錄號為EF121242),其長度為822 bp,該基因ORF區覈苷痠序列與其他物種相比同源性達到93%以上,氨基痠同源性則達到89%以上,生物信息學分析錶明該蛋白分子量為22.25kD,等電點pI=8.30,包含199箇氨基痠殘基.該基因cDNA序列的剋隆,有利于進一步研究SOCS-2調節機體髮育的分子機理.
종중국지방저품충팔미저(BaMei)신장조직중제취총RNA,채용RT-PCB방법극륭료저SOCS-2(suppressor of cytokine signaling-2,세포인자신호전도억제인자-2)기인적cDNA서렬,경T/A극륭,삽입도pMD19-T재체상,도입대장간균DH-5α,양성극륭경PCR감정후진행측서,장측서결과여GenBank중이등록적인、대서화소서SOCS-2기인적서렬진행동원성비교,이용생물신식학화분자생물학연건대저SOCS-2기인편마적단백진행결구예측.결과표명:수차성공극륭료저SOCS-2기인적cDNA서렬(GenBank등록호위EF121242),기장도위822 bp,해기인ORF구핵감산서렬여기타물충상비동원성체도93%이상,안기산동원성칙체도89%이상,생물신식학분석표명해단백분자량위22.25kD,등전점pI=8.30,포함199개안기산잔기.해기인cDNA서렬적극륭,유리우진일보연구SOCS-2조절궤체발육적분자궤리.