生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2000年
4期
418-422
,共5页
冯健男%任蕴芳%倪长源%吴加金%沈倍奋
馮健男%任蘊芳%倪長源%吳加金%瀋倍奮
풍건남%임온방%예장원%오가금%침배강
人白介素6%gp130%人白介素6受体%表观静电势%分子力学%分子动力学
人白介素6%gp130%人白介素6受體%錶觀靜電勢%分子力學%分子動力學
인백개소6%gp130%인백개소6수체%표관정전세%분자역학%분자동역학
通过Delphi方法分析人白介素6(human interleukin-6,hIL-6)/人白介素6受体α亚基(human interleukin-6 receptor α subunit,hIL-6Rα)复合物、gp130(β subunit)的空间构象的表观静电分布,利用分子对接方法研究gp130与hIL-6/hIL-6Rα复合物作用形成三元复合物的空间构象,经过分子力学优化、分子动力学常温动态模拟借助分子间相互作用(范德华力、氢键、盐键等)、反应自由能理论探讨hIL-6·hIL-6Rα·gp130复合物稳定构象结合部位的结构域.分析结果表明,gp130蛋白表面富集较强的负电势,复合物hIL-6/hIL-6R一侧表面富集较强的正电势,gp130借助蛋白表面的静电作用结合hIL-6/hIL-6R复合物,介导hIL-6信号;hIL-6中的helix-C、loop-BC、loop-CD参与同gp130中的loopEF、linker、loopA′B′、loopB′C′、loopD′E′作用,hIL-6R中的loopA′B′、β-strand E′参与同gp130中的loopA′B′、β-strand E′作用.
通過Delphi方法分析人白介素6(human interleukin-6,hIL-6)/人白介素6受體α亞基(human interleukin-6 receptor α subunit,hIL-6Rα)複閤物、gp130(β subunit)的空間構象的錶觀靜電分佈,利用分子對接方法研究gp130與hIL-6/hIL-6Rα複閤物作用形成三元複閤物的空間構象,經過分子力學優化、分子動力學常溫動態模擬藉助分子間相互作用(範德華力、氫鍵、鹽鍵等)、反應自由能理論探討hIL-6·hIL-6Rα·gp130複閤物穩定構象結閤部位的結構域.分析結果錶明,gp130蛋白錶麵富集較彊的負電勢,複閤物hIL-6/hIL-6R一側錶麵富集較彊的正電勢,gp130藉助蛋白錶麵的靜電作用結閤hIL-6/hIL-6R複閤物,介導hIL-6信號;hIL-6中的helix-C、loop-BC、loop-CD參與同gp130中的loopEF、linker、loopA′B′、loopB′C′、loopD′E′作用,hIL-6R中的loopA′B′、β-strand E′參與同gp130中的loopA′B′、β-strand E′作用.
통과Delphi방법분석인백개소6(human interleukin-6,hIL-6)/인백개소6수체α아기(human interleukin-6 receptor α subunit,hIL-6Rα)복합물、gp130(β subunit)적공간구상적표관정전분포,이용분자대접방법연구gp130여hIL-6/hIL-6Rα복합물작용형성삼원복합물적공간구상,경과분자역학우화、분자동역학상온동태모의차조분자간상호작용(범덕화력、경건、염건등)、반응자유능이론탐토hIL-6·hIL-6Rα·gp130복합물은정구상결합부위적결구역.분석결과표명,gp130단백표면부집교강적부전세,복합물hIL-6/hIL-6R일측표면부집교강적정전세,gp130차조단백표면적정전작용결합hIL-6/hIL-6R복합물,개도hIL-6신호;hIL-6중적helix-C、loop-BC、loop-CD삼여동gp130중적loopEF、linker、loopA′B′、loopB′C′、loopD′E′작용,hIL-6R중적loopA′B′、β-strand E′삼여동gp130중적loopA′B′、β-strand E′작용.
