化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2003年
7期
1129-1135
,共7页
比较分子场分析(CoMFA),R2引导的区域选择法(q2-GRS),全取向搜索法和全空间搜索法(AOS/APS),比较分子相似性指数分析(CoMSIA),血小板活化因子(PAF)拮抗剂
比較分子場分析(CoMFA),R2引導的區域選擇法(q2-GRS),全取嚮搜索法和全空間搜索法(AOS/APS),比較分子相似性指數分析(CoMSIA),血小闆活化因子(PAF)拮抗劑
비교분자장분석(CoMFA),R2인도적구역선택법(q2-GRS),전취향수색법화전공간수색법(AOS/APS),비교분자상사성지수분석(CoMSIA),혈소판활화인자(PAF)길항제
由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R2引导的区域选择法(q2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q2值均比传统CoMFA的高.q2-GRS方法得到的q2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q2较为理想,而在CoMSIA中,q2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.
由于傳統的比較分子場分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的疊閤規則以及疊閤分子的空間取嚮和空間位置等因素對q2的影響很大,因此相繼提齣瞭幾種改進的CoMFA方法.為瞭優化CoMFA結果,應用傳統的CoMFA方法和交扠驗證的R2引導的區域選擇法(q2-GRS)、全取嚮搜索法(AOS)、全空間搜索法(APS)以及比較分子相似性指數(CoMSIA)等四種改進的CoMFA方法,對18箇pinusolide類衍生物這類新髮現的血小闆活化因子(PAF)拮抗劑進行瞭比較研究.結果錶明四種改進的CoMFA方法得到的q2值均比傳統CoMFA的高.q2-GRS方法得到的q2值有所提高,但綜閤結果併不理想,AOS與APS得到的q2較為理想,而在CoMSIA中,q2幾乎不受空間取嚮或空間位置的影響.同時我們引入基于樣本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的傳統PLS進行統計分析,明顯提高瞭其運行速度.最後,根據q2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型設計瞭幾箇預測活性更高的pinusolide類似物.
유우전통적비교분자장분석(CoMFA)방법본신존재일사결함,사득분자적첩합규칙이급첩합분자적공간취향화공간위치등인소대q2적영향흔대,인차상계제출료궤충개진적CoMFA방법.위료우화CoMFA결과,응용전통적CoMFA방법화교차험증적R2인도적구역선택법(q2-GRS)、전취향수색법(AOS)、전공간수색법(APS)이급비교분자상사성지수(CoMSIA)등사충개진적CoMFA방법,대18개pinusolide류연생물저류신발현적혈소판활화인자(PAF)길항제진행료비교연구.결과표명사충개진적CoMFA방법득도적q2치균비전통CoMFA적고.q2-GRS방법득도적q2치유소제고,단종합결과병불이상,AOS여APS득도적q2교위이상,이재CoMSIA중,q2궤호불수공간취향혹공간위치적영향.동시아문인입기우양본적편최소이승법(SAMPLS)취대원AOS/APS정서중적전통PLS진행통계분석,명현제고료기운행속도.최후,근거q2최고적CoMFA모형화CoMSIA모형설계료궤개예측활성경고적pinusolide유사물.
