南京农业大学学报
南京農業大學學報
남경농업대학학보
JOURNAL OF NANJING AGRICULTURAL UNIVERSITY
2010年
4期
42-48
,共7页
熊玉芬%王暄%梁中伟%李红梅
熊玉芬%王暄%樑中偉%李紅梅
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松材线虫%乙酰胆碱酯酶基因%cDNA克隆%RACE
鬆材線蟲%乙酰膽堿酯酶基因%cDNA剋隆%RACE
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利用RT-PCR和RACE技术克隆了一个松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)乙酰胆碱酯酶基因Bx-ace-2,该基因cDNA全长为2 010 bp,有1 878 bp的开放阅读框(ORF),推测其编码的蛋白有625个氨基酸;Bx-ace-2基因组克隆长为2 192 bp,含有7个内含子.氨基酸序列比对和同源性分析显示:松材线虫Bx-ace-2编码的乙酰胆碱酯酶与已报道的秀丽小杆线虫ACE-1、ACE-3和ACE-4型乙酰胆碱酯酶的相似性为28%~31%,而与秀丽小杆线虫ACE-2及甘薯茎线虫、南方根结线虫、大豆胞囊线虫、马铃薯白线虫和胎生网尾线虫的ACE-2型乙酰胆碱酯酶的氨基酸序列相似性为44%~52%.构建的系统进化树也显示:松材线虫乙酰胆碱酯酶与其他线虫的ACE-2型乙酰胆碱酯酶具有相对更近的遗传距离,因此推测该松材线虫乙酰胆碱酯酶也属于ACE-2型.
利用RT-PCR和RACE技術剋隆瞭一箇鬆材線蟲(Bursaphelenchus xylophilus)乙酰膽堿酯酶基因Bx-ace-2,該基因cDNA全長為2 010 bp,有1 878 bp的開放閱讀框(ORF),推測其編碼的蛋白有625箇氨基痠;Bx-ace-2基因組剋隆長為2 192 bp,含有7箇內含子.氨基痠序列比對和同源性分析顯示:鬆材線蟲Bx-ace-2編碼的乙酰膽堿酯酶與已報道的秀麗小桿線蟲ACE-1、ACE-3和ACE-4型乙酰膽堿酯酶的相似性為28%~31%,而與秀麗小桿線蟲ACE-2及甘藷莖線蟲、南方根結線蟲、大豆胞囊線蟲、馬鈴藷白線蟲和胎生網尾線蟲的ACE-2型乙酰膽堿酯酶的氨基痠序列相似性為44%~52%.構建的繫統進化樹也顯示:鬆材線蟲乙酰膽堿酯酶與其他線蟲的ACE-2型乙酰膽堿酯酶具有相對更近的遺傳距離,因此推測該鬆材線蟲乙酰膽堿酯酶也屬于ACE-2型.
이용RT-PCR화RACE기술극륭료일개송재선충(Bursaphelenchus xylophilus)을선담감지매기인Bx-ace-2,해기인cDNA전장위2 010 bp,유1 878 bp적개방열독광(ORF),추측기편마적단백유625개안기산;Bx-ace-2기인조극륭장위2 192 bp,함유7개내함자.안기산서렬비대화동원성분석현시:송재선충Bx-ace-2편마적을선담감지매여이보도적수려소간선충ACE-1、ACE-3화ACE-4형을선담감지매적상사성위28%~31%,이여수려소간선충ACE-2급감서경선충、남방근결선충、대두포낭선충、마령서백선충화태생망미선충적ACE-2형을선담감지매적안기산서렬상사성위44%~52%.구건적계통진화수야현시:송재선충을선담감지매여기타선충적ACE-2형을선담감지매구유상대경근적유전거리,인차추측해송재선충을선담감지매야속우ACE-2형.