物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2005年
5期
499-503
,共5页
泉生热袍菌%结构基因组%选靶%蛋白质结构%BLAST%PSI-BLAST%ProtoNet
泉生熱袍菌%結構基因組%選靶%蛋白質結構%BLAST%PSI-BLAST%ProtoNet
천생열포균%결구기인조%선파%단백질결구%BLAST%PSI-BLAST%ProtoNet
对泉生热袍菌进行了结构基因组的选靶研究,从泉生热袍菌的蛋白组中挑选了20个蛋白质作为第一批进行结构测定的目标,以发现新的蛋白质折叠模式.选靶研究主要使用了BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet数据库搜索等方法.另外,还用PredictProtein程序对选中的蛋白质进行了二级结构和外形预测.选中的20个蛋白质中有8个被克隆、表达和纯化,其中2个得到了单晶并收集了X衍射数据.实验结果和最近一些文献报道的结果表明,挑选的一些蛋白质具有新的折叠模式,表明了这种选靶策略的有效性.
對泉生熱袍菌進行瞭結構基因組的選靶研究,從泉生熱袍菌的蛋白組中挑選瞭20箇蛋白質作為第一批進行結構測定的目標,以髮現新的蛋白質摺疊模式.選靶研究主要使用瞭BLAST搜索,PSI-BLAST搜索和ProtoNet數據庫搜索等方法.另外,還用PredictProtein程序對選中的蛋白質進行瞭二級結構和外形預測.選中的20箇蛋白質中有8箇被剋隆、錶達和純化,其中2箇得到瞭單晶併收集瞭X衍射數據.實驗結果和最近一些文獻報道的結果錶明,挑選的一些蛋白質具有新的摺疊模式,錶明瞭這種選靶策略的有效性.
대천생열포균진행료결구기인조적선파연구,종천생열포균적단백조중도선료20개단백질작위제일비진행결구측정적목표,이발현신적단백질절첩모식.선파연구주요사용료BLAST수색,PSI-BLAST수색화ProtoNet수거고수색등방법.령외,환용PredictProtein정서대선중적단백질진행료이급결구화외형예측.선중적20개단백질중유8개피극륭、표체화순화,기중2개득도료단정병수집료X연사수거.실험결과화최근일사문헌보도적결과표명,도선적일사단백질구유신적절첩모식,표명료저충선파책략적유효성.
