海洋学报（中文版）
海洋學報（中文版）
해양학보（중문판）
ACTA OCEANOLOGICA SINICA
2011年
5期
115-123
,共9页
肖志忠%肖永双%马道远%徐世宏%刘清华%李军
肖誌忠%肖永雙%馬道遠%徐世宏%劉清華%李軍
초지충%초영쌍%마도원%서세굉%류청화%리군
条石鲷%斑石鲷%线粒体DNA%遗传距离%分化时间
條石鯛%斑石鯛%線粒體DNA%遺傳距離%分化時間
조석조%반석조%선립체DNA%유전거리%분화시간
比较分析了条石鲷和斑石鲷线粒体基因组COI、Cyt b基因以及D-loop片段总长度为1 948 bp的核苷酸序列,探讨了条石鲷和斑石鲷的遗传分化程度.两种间共检测到314个多态位点,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是发生在密码子第3位点上的同义替换.核苷酸组成分析结果表明:三个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在两个蛋白质编码基因密码子第3位点上表现得尤为明显.基于线粒体COI,Cyt b基因和D-loop片段序列分析结果显示条石鲷和斑石鲷间平均遗传距离分别为0.097,0.080和0.172,属于属内种间差异水平.两种石鲷科鱼类在线粒体基因组不同片段上存在明显的遗传差异,核苷酸替代速率由大到小依次为D-loop＞COI＞Cyt b.与以往的研究不同,条石鲷和斑石鲷线粒体COI基因片段上的核苷酸替代速率明显的高于Cyt b基因片段,呈现出较快的进化速率.基于Cyt b和ND5两个基因片段序列的分析结果表明:条石鲷和斑石鲷的分歧时间约为385万～530万a,分化事件发生于上新世早期(Early Pliocene).
比較分析瞭條石鯛和斑石鯛線粒體基因組COI、Cyt b基因以及D-loop片段總長度為1 948 bp的覈苷痠序列,探討瞭條石鯛和斑石鯛的遺傳分化程度.兩種間共檢測到314箇多態位點,蛋白質編碼基因上的覈苷痠替代主要是髮生在密碼子第3位點上的同義替換.覈苷痠組成分析結果錶明:三箇目的片段的鳥嘌呤(G)含量普遍較低,在兩箇蛋白質編碼基因密碼子第3位點上錶現得尤為明顯.基于線粒體COI,Cyt b基因和D-loop片段序列分析結果顯示條石鯛和斑石鯛間平均遺傳距離分彆為0.097,0.080和0.172,屬于屬內種間差異水平.兩種石鯛科魚類在線粒體基因組不同片段上存在明顯的遺傳差異,覈苷痠替代速率由大到小依次為D-loop＞COI＞Cyt b.與以往的研究不同,條石鯛和斑石鯛線粒體COI基因片段上的覈苷痠替代速率明顯的高于Cyt b基因片段,呈現齣較快的進化速率.基于Cyt b和ND5兩箇基因片段序列的分析結果錶明:條石鯛和斑石鯛的分歧時間約為385萬～530萬a,分化事件髮生于上新世早期(Early Pliocene).
비교분석료조석조화반석조선립체기인조COI、Cyt b기인이급D-loop편단총장도위1 948 bp적핵감산서렬,탐토료조석조화반석조적유전분화정도.량충간공검측도314개다태위점,단백질편마기인상적핵감산체대주요시발생재밀마자제3위점상적동의체환.핵감산조성분석결과표명:삼개목적편단적조표령(G)함량보편교저,재량개단백질편마기인밀마자제3위점상표현득우위명현.기우선립체COI,Cyt b기인화D-loop편단서렬분석결과현시조석조화반석조간평균유전거리분별위0.097,0.080화0.172,속우속내충간차이수평.량충석조과어류재선립체기인조불동편단상존재명현적유전차이,핵감산체대속솔유대도소의차위D-loop＞COI＞Cyt b.여이왕적연구불동,조석조화반석조선립체COI기인편단상적핵감산체대속솔명현적고우Cyt b기인편단,정현출교쾌적진화속솔.기우Cyt b화ND5량개기인편단서렬적분석결과표명:조석조화반석조적분기시간약위385만～530만a,분화사건발생우상신세조기(Early Pliocene).
