计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2010年
12期
1613-1616
,共4页
密码子用法数据库%图形化密码子用法分析器%密码子偏好%相对适应度%CUDassist软件
密碼子用法數據庫%圖形化密碼子用法分析器%密碼子偏好%相對適應度%CUDassist軟件
밀마자용법수거고%도형화밀마자용법분석기%밀마자편호%상대괄응도%CUDassist연건
密码子用法的研究是遗传密码的进化、基因的水平转移、基因表达的调控和异源表达的优化等领域不可或缺的内容.2个重要的密码子用法在线服务密码子用法数据库(CUD)和图形化密码子用法分析器(GCUA)为研究者提供了有力的数据支持,但仍存在一些问题,如密码子用法数据库可接受的检索方式过于单一,在特定密码子用法表(CUT)中Fraction参数值显示有误,图形化密码子用法分析器仪提供2个密码子用法表的比对视图等.本文针对这些问题,研发了密码子用法数据库辅助工具"CUDassist",做出4个改进: (1)增加密码子用法数据库的可检索方式;(2)修正密码子用法数据库中Fraction值显示错误的问题;(3)在密码子用法表中直接给出相对适应度(RA)参数值;(4)提供多个密码子用法表的比对视图.从而为研究者提供更方便、准确和丰富的密码子用法的信息,并在一定程度上有效融合了密码子用法数据库和图形化密码子用法分析器的功能,实现一站式服务.
密碼子用法的研究是遺傳密碼的進化、基因的水平轉移、基因錶達的調控和異源錶達的優化等領域不可或缺的內容.2箇重要的密碼子用法在線服務密碼子用法數據庫(CUD)和圖形化密碼子用法分析器(GCUA)為研究者提供瞭有力的數據支持,但仍存在一些問題,如密碼子用法數據庫可接受的檢索方式過于單一,在特定密碼子用法錶(CUT)中Fraction參數值顯示有誤,圖形化密碼子用法分析器儀提供2箇密碼子用法錶的比對視圖等.本文針對這些問題,研髮瞭密碼子用法數據庫輔助工具"CUDassist",做齣4箇改進: (1)增加密碼子用法數據庫的可檢索方式;(2)脩正密碼子用法數據庫中Fraction值顯示錯誤的問題;(3)在密碼子用法錶中直接給齣相對適應度(RA)參數值;(4)提供多箇密碼子用法錶的比對視圖.從而為研究者提供更方便、準確和豐富的密碼子用法的信息,併在一定程度上有效融閤瞭密碼子用法數據庫和圖形化密碼子用法分析器的功能,實現一站式服務.
밀마자용법적연구시유전밀마적진화、기인적수평전이、기인표체적조공화이원표체적우화등영역불가혹결적내용.2개중요적밀마자용법재선복무밀마자용법수거고(CUD)화도형화밀마자용법분석기(GCUA)위연구자제공료유력적수거지지,단잉존재일사문제,여밀마자용법수거고가접수적검색방식과우단일,재특정밀마자용법표(CUT)중Fraction삼수치현시유오,도형화밀마자용법분석기의제공2개밀마자용법표적비대시도등.본문침대저사문제,연발료밀마자용법수거고보조공구"CUDassist",주출4개개진: (1)증가밀마자용법수거고적가검색방식;(2)수정밀마자용법수거고중Fraction치현시착오적문제;(3)재밀마자용법표중직접급출상대괄응도(RA)삼수치;(4)제공다개밀마자용법표적비대시도.종이위연구자제공경방편、준학화봉부적밀마자용법적신식,병재일정정도상유효융합료밀마자용법수거고화도형화밀마자용법분석기적공능,실현일참식복무.
