河南农业科学
河南農業科學
하남농업과학
JOURNAL OF HENAN AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
4期
38-44
,共7页
拟南芥%生物信息学%核苷二磷酸激酶家族%序列分析%系统分析
擬南芥%生物信息學%覈苷二燐痠激酶傢族%序列分析%繫統分析
의남개%생물신식학%핵감이린산격매가족%서렬분석%계통분석
为研究拟南芥核苷二磷酸激酶家族(AtNDPKs)5个成员之间的差异,对其在蛋白质结构、磷酸化位点、信号肽序列、功能区方面的差异进行了生物信息学的比较分析,并建立了系统进化树.结果显示,5个成员在等电点、吸光值和亲水性方面的差异明显.二级结构中,AtNDPK2的α螺旋比例与其他成员差异显著；在β转角和无规则卷曲方面,AtNDPK1a与AtNDPK3a表现出相反的情况.5个成员各含有1个NDK结构域,但分布位置不同.AtNDPK3a中酪氨酸磷酸化明显增多,AtNDPK1a的磷酸化位点与其他成员差异显著.AtNDPK1和AtNDPK2的信号肽裂解点位于第16和17位氨基酸之间,AtNDPK3和AtNDPK3a的位于第42和43位之间,而AtNDPK1a的位于第24和25位之间.AtNDPK1a的进化地位高于其他成员,AtNDPK3与AtNDPK3a的亲缘关系最近,而AtNDPK1与其他成员的亲缘关系较远.
為研究擬南芥覈苷二燐痠激酶傢族(AtNDPKs)5箇成員之間的差異,對其在蛋白質結構、燐痠化位點、信號肽序列、功能區方麵的差異進行瞭生物信息學的比較分析,併建立瞭繫統進化樹.結果顯示,5箇成員在等電點、吸光值和親水性方麵的差異明顯.二級結構中,AtNDPK2的α螺鏇比例與其他成員差異顯著；在β轉角和無規則捲麯方麵,AtNDPK1a與AtNDPK3a錶現齣相反的情況.5箇成員各含有1箇NDK結構域,但分佈位置不同.AtNDPK3a中酪氨痠燐痠化明顯增多,AtNDPK1a的燐痠化位點與其他成員差異顯著.AtNDPK1和AtNDPK2的信號肽裂解點位于第16和17位氨基痠之間,AtNDPK3和AtNDPK3a的位于第42和43位之間,而AtNDPK1a的位于第24和25位之間.AtNDPK1a的進化地位高于其他成員,AtNDPK3與AtNDPK3a的親緣關繫最近,而AtNDPK1與其他成員的親緣關繫較遠.
위연구의남개핵감이린산격매가족(AtNDPKs)5개성원지간적차이,대기재단백질결구、린산화위점、신호태서렬、공능구방면적차이진행료생물신식학적비교분석,병건립료계통진화수.결과현시,5개성원재등전점、흡광치화친수성방면적차이명현.이급결구중,AtNDPK2적α라선비례여기타성원차이현저；재β전각화무규칙권곡방면,AtNDPK1a여AtNDPK3a표현출상반적정황.5개성원각함유1개NDK결구역,단분포위치불동.AtNDPK3a중락안산린산화명현증다,AtNDPK1a적린산화위점여기타성원차이현저.AtNDPK1화AtNDPK2적신호태렬해점위우제16화17위안기산지간,AtNDPK3화AtNDPK3a적위우제42화43위지간,이AtNDPK1a적위우제24화25위지간.AtNDPK1a적진화지위고우기타성원,AtNDPK3여AtNDPK3a적친연관계최근,이AtNDPK1여기타성원적친연관계교원.
