人类学学报
人類學學報
인류학학보
ACTA ANTHROPOLOGICA SINICA
2005年
3期
221-231
,共11页
薛付忠%王洁贞%郭亦寿%胡平
薛付忠%王潔貞%郭亦壽%鬍平
설부충%왕길정%곽역수%호평
人类群体遗传结构%主成分分析%中心化(或均值化)协方差阵%HLA-A
人類群體遺傳結構%主成分分析%中心化(或均值化)協方差陣%HLA-A
인류군체유전결구%주성분분석%중심화(혹균치화)협방차진%HLA-A
目的:探讨基因频率矩阵的中心化(或均值化)协方差阵主成分分析方法在人类群体遗传结构研究中的适用性和合理性.方法:从基因频率矩阵的结构特征入手,分析中心化、均值化协方差阵主成分分析与标准化相关阵主成分分析在特征根、特征向量以及降维效果等方面的差异,并通过实例比较不同方法在解释群体遗传结构特征上合理性.结果:中心化(或均值化)协方差阵的主成分不仅反映了基因变异程度的"方差信息量权",而且反映了基因间相互影响程度的"相关信息量权";标准化相关阵的主成分反映的仅是"相关信息量权",不包括"方差信息量权".通过比较中国26个汉族人群HLA-A基因座中心化协方差阵和标准化相关阵2种主成分分析结果,证实中心化协方差阵主成分分析方法在特征根与特征向量、保留主成分的个数和对主成分的群体遗传学解释的合理性等方面均优于标准化相关阵主成分分析方法.结论:在对群体遗传结构进行主成分分析时,应使用中心化(或均值化)变换消除基因频率矩阵中量级的影响,然后在用其协方差阵提取主成分.
目的:探討基因頻率矩陣的中心化(或均值化)協方差陣主成分分析方法在人類群體遺傳結構研究中的適用性和閤理性.方法:從基因頻率矩陣的結構特徵入手,分析中心化、均值化協方差陣主成分分析與標準化相關陣主成分分析在特徵根、特徵嚮量以及降維效果等方麵的差異,併通過實例比較不同方法在解釋群體遺傳結構特徵上閤理性.結果:中心化(或均值化)協方差陣的主成分不僅反映瞭基因變異程度的"方差信息量權",而且反映瞭基因間相互影響程度的"相關信息量權";標準化相關陣的主成分反映的僅是"相關信息量權",不包括"方差信息量權".通過比較中國26箇漢族人群HLA-A基因座中心化協方差陣和標準化相關陣2種主成分分析結果,證實中心化協方差陣主成分分析方法在特徵根與特徵嚮量、保留主成分的箇數和對主成分的群體遺傳學解釋的閤理性等方麵均優于標準化相關陣主成分分析方法.結論:在對群體遺傳結構進行主成分分析時,應使用中心化(或均值化)變換消除基因頻率矩陣中量級的影響,然後在用其協方差陣提取主成分.
목적:탐토기인빈솔구진적중심화(혹균치화)협방차진주성분분석방법재인류군체유전결구연구중적괄용성화합이성.방법:종기인빈솔구진적결구특정입수,분석중심화、균치화협방차진주성분분석여표준화상관진주성분분석재특정근、특정향량이급강유효과등방면적차이,병통과실례비교불동방법재해석군체유전결구특정상합이성.결과:중심화(혹균치화)협방차진적주성분불부반영료기인변이정도적"방차신식량권",이차반영료기인간상호영향정도적"상관신식량권";표준화상관진적주성분반영적부시"상관신식량권",불포괄"방차신식량권".통과비교중국26개한족인군HLA-A기인좌중심화협방차진화표준화상관진2충주성분분석결과,증실중심화협방차진주성분분석방법재특정근여특정향량、보류주성분적개수화대주성분적군체유전학해석적합이성등방면균우우표준화상관진주성분분석방법.결론:재대군체유전결구진행주성분분석시,응사용중심화(혹균치화)변환소제기인빈솔구진중량급적영향,연후재용기협방차진제취주성분.