中华流行病学杂志
中華流行病學雜誌
중화류행병학잡지
CHINESE JOURNAL OF EPIDEMIOLOGY
2009年
5期
489-492
,共4页
徐晓立%杨建军%任瑞文%刘建伟%马四辈%白志军%方美玉
徐曉立%楊建軍%任瑞文%劉建偉%馬四輩%白誌軍%方美玉
서효립%양건군%임서문%류건위%마사배%백지군%방미옥
黄病毒%抗原表位%原核表达
黃病毒%抗原錶位%原覈錶達
황병독%항원표위%원핵표체
Flavivirus%Protein epitopes%Prokaryotic expression
目的 对主要黄病毒结构蛋白的抗原表位情况进行系统分析,鉴别共同及特异性抗原表位并对可能的特异性抗原表位进行原核表达.方法 分别利用DNAStar及ANTHEPROT软件对登革病毒1~4型、流行性乙型脑炎(乙脑)病毒及黄热病毒E蛋白的亲水性、抗原性、可塑性、表面可及性和Garnier-Robson的二级结构进行分析,预测可能的抗原表位.在此基础上,根据表位位置和氨基酸序列的相似性,分析6种病毒的共有及特异性抗原表位,并参考GenBank中的序列信息,对预测的抗原表位进行比对,进一步分析抗原表位在不同病毒株中的保守性.然后利用pET32及pMAL-c2x系统对可能的特异性抗原表位进行高效原核表达、Western blot验证其抗原性.结果 经系统的生物信息学分析,共预测获得登革病毒1~4型、乙脑病毒及黄热病毒共有抗原表位15个,病毒特异性抗原表位47个.利用pET32及pMAL-c2x系统对6种病毒部分可能的特异性抗原表位进行了高效表达.Western blot结果显示登革病毒1型及2型表达抗原片段表现良好的抗原反应原性,并与试验中所用其他黄病毒及甲病毒多克隆抗体无明显的交叉反应.而所表达的登革病毒3型和4型、乙脑病毒及黄热病毒片段无抗原反应原性.结论 6条原核表达抗原片段经Western blot验证,获得登革病毒1型和2型特异性抗原片段.
目的 對主要黃病毒結構蛋白的抗原錶位情況進行繫統分析,鑒彆共同及特異性抗原錶位併對可能的特異性抗原錶位進行原覈錶達.方法 分彆利用DNAStar及ANTHEPROT軟件對登革病毒1~4型、流行性乙型腦炎(乙腦)病毒及黃熱病毒E蛋白的親水性、抗原性、可塑性、錶麵可及性和Garnier-Robson的二級結構進行分析,預測可能的抗原錶位.在此基礎上,根據錶位位置和氨基痠序列的相似性,分析6種病毒的共有及特異性抗原錶位,併參攷GenBank中的序列信息,對預測的抗原錶位進行比對,進一步分析抗原錶位在不同病毒株中的保守性.然後利用pET32及pMAL-c2x繫統對可能的特異性抗原錶位進行高效原覈錶達、Western blot驗證其抗原性.結果 經繫統的生物信息學分析,共預測穫得登革病毒1~4型、乙腦病毒及黃熱病毒共有抗原錶位15箇,病毒特異性抗原錶位47箇.利用pET32及pMAL-c2x繫統對6種病毒部分可能的特異性抗原錶位進行瞭高效錶達.Western blot結果顯示登革病毒1型及2型錶達抗原片段錶現良好的抗原反應原性,併與試驗中所用其他黃病毒及甲病毒多剋隆抗體無明顯的交扠反應.而所錶達的登革病毒3型和4型、乙腦病毒及黃熱病毒片段無抗原反應原性.結論 6條原覈錶達抗原片段經Western blot驗證,穫得登革病毒1型和2型特異性抗原片段.
목적 대주요황병독결구단백적항원표위정황진행계통분석,감별공동급특이성항원표위병대가능적특이성항원표위진행원핵표체.방법 분별이용DNAStar급ANTHEPROT연건대등혁병독1~4형、류행성을형뇌염(을뇌)병독급황열병독E단백적친수성、항원성、가소성、표면가급성화Garnier-Robson적이급결구진행분석,예측가능적항원표위.재차기출상,근거표위위치화안기산서렬적상사성,분석6충병독적공유급특이성항원표위,병삼고GenBank중적서렬신식,대예측적항원표위진행비대,진일보분석항원표위재불동병독주중적보수성.연후이용pET32급pMAL-c2x계통대가능적특이성항원표위진행고효원핵표체、Western blot험증기항원성.결과 경계통적생물신식학분석,공예측획득등혁병독1~4형、을뇌병독급황열병독공유항원표위15개,병독특이성항원표위47개.이용pET32급pMAL-c2x계통대6충병독부분가능적특이성항원표위진행료고효표체.Western blot결과현시등혁병독1형급2형표체항원편단표현량호적항원반응원성,병여시험중소용기타황병독급갑병독다극륭항체무명현적교차반응.이소표체적등혁병독3형화4형、을뇌병독급황열병독편단무항원반응원성.결론 6조원핵표체항원편단경Western blot험증,획득등혁병독1형화2형특이성항원편단.
Objective To analysis the E protein epitopes of dengue virus type 1-4, Japanese encephalitis virus and yellow fever virus and to distinguish the shared or specific epitopes among them. Methods Bioinformatic software DNAStar was used to analyze the hydrophilicity, flexibility, surface probability and antigenicity of dengue virus type 1-4, Japanese encephalitis virus and yellow fever virus E prtein amino acid sequences. The influence of secondary structure was also considered. Based on the bio-informatic analysis of E protein epitopes, 6 specific epitopes were amplified and inserted into prokaryotic expression vector pMAL-c2x. The vectors was then transferred into E.coli BL21 (DE3) and Rosetta (DE3). Isopropyl-β-D-thiogalactoside (IPTG) was used to induce the expression of gene segments and SDS-PAGE were used identify the expression proteins. The antigenieity was tested, using Western blot. Results 15 shared epitopes and 47 specific epitopes were forecasted by bioinformatic analysis, and 6 specific epitopes from dengue virus type 1-4, Japanese encephalitis virus and yellow fever virus E protein were expressed in E.coli successfully. Two specific antigenic determinant from dengue virus type 1 and dengue virus type 2 were confirmed using Western blot, while the others epitopes shown no antigenic reaction property. Conclusion Two specific antigenic determinant were confirmed, under Western blot.