中国生物化学与分子生物学报
中國生物化學與分子生物學報
중국생물화학여분자생물학보
CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
2004年
3期
294-304
,共11页
宋平%张竞男%胡珈瑞%李奎
宋平%張競男%鬍珈瑞%李奎
송평%장경남%호가서%리규
真核翻译起始因子4A(eukaryotic initiation factor 4A,eIF-4A),RNA解旋酶,ATP酶,食蟹猴疟原虫(Plasmodium cynomolgi)
真覈翻譯起始因子4A(eukaryotic initiation factor 4A,eIF-4A),RNA解鏇酶,ATP酶,食蟹猴瘧原蟲(Plasmodium cynomolgi)
진핵번역기시인자4A(eukaryotic initiation factor 4A,eIF-4A),RNA해선매,ATP매,식해후학원충(Plasmodium cynomolgi)
eIF-4A%RNA helicase%ATPase%Plasmodium cynomolgi
真核翻译起始因子4A(eukaryotic initiation factor 4A,eIF-4A)是DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类中的一个原型成员.它在真核细胞的蛋白质合成的起始过程中起着关键性作用.通过PCR扩增和放射探针杂交相结合的方法筛选食蟹猴疟原虫(Plasmodium cynomolgi)的cDNA文库,克隆了一个eIF-4A同源蛋白的完整cDNA序列,命名为CH1 F.CHl F全长1753 bp,包含一个1197 bp的完整阅读框,推测编码一个由398个氨基酸组成的蛋白.对CH1F的蛋白序列用BlastP进行搜索和分析,提示它应该是DEAD盒家族的一个eIF-4A同源蛋白;用DNAStar将其与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析,结果显示:比起其它的DEAD盒蛋白,它与eIF-4A或eIF-4A的同源蛋白具有更高的同源性和更多序列上的相似结构域.将包含完整阅读框的片段亚克隆进表达载体pET-28a(+),在大肠杆菌DH5α中表达,产生的融合蛋白大小在45 kD左右.对该融合蛋白进行纯化、重新折叠和初步鉴定.ATP酶活性检测显示,该融合蛋白只有很低的ATP酶活性,而且它的ATP酶活性似乎不依赖于核酸底物.对这一检测结果给出3种可能的原因.这一检测结果与根据序列分析得到的推论--CH1F蛋白可能是一个eIF-4A并不矛盾.
真覈翻譯起始因子4A(eukaryotic initiation factor 4A,eIF-4A)是DEAD盒蛋白傢族的ATP依賴性的RNA解鏇酶類中的一箇原型成員.它在真覈細胞的蛋白質閤成的起始過程中起著關鍵性作用.通過PCR擴增和放射探針雜交相結閤的方法篩選食蟹猴瘧原蟲(Plasmodium cynomolgi)的cDNA文庫,剋隆瞭一箇eIF-4A同源蛋白的完整cDNA序列,命名為CH1 F.CHl F全長1753 bp,包含一箇1197 bp的完整閱讀框,推測編碼一箇由398箇氨基痠組成的蛋白.對CH1F的蛋白序列用BlastP進行搜索和分析,提示它應該是DEAD盒傢族的一箇eIF-4A同源蛋白;用DNAStar將其與許多典型的DEAD盒蛋白序列進行比對分析,結果顯示:比起其它的DEAD盒蛋白,它與eIF-4A或eIF-4A的同源蛋白具有更高的同源性和更多序列上的相似結構域.將包含完整閱讀框的片段亞剋隆進錶達載體pET-28a(+),在大腸桿菌DH5α中錶達,產生的融閤蛋白大小在45 kD左右.對該融閤蛋白進行純化、重新摺疊和初步鑒定.ATP酶活性檢測顯示,該融閤蛋白隻有很低的ATP酶活性,而且它的ATP酶活性似乎不依賴于覈痠底物.對這一檢測結果給齣3種可能的原因.這一檢測結果與根據序列分析得到的推論--CH1F蛋白可能是一箇eIF-4A併不矛盾.
진핵번역기시인자4A(eukaryotic initiation factor 4A,eIF-4A)시DEAD합단백가족적ATP의뢰성적RNA해선매류중적일개원형성원.타재진핵세포적단백질합성적기시과정중기착관건성작용.통과PCR확증화방사탐침잡교상결합적방법사선식해후학원충(Plasmodium cynomolgi)적cDNA문고,극륭료일개eIF-4A동원단백적완정cDNA서렬,명명위CH1 F.CHl F전장1753 bp,포함일개1197 bp적완정열독광,추측편마일개유398개안기산조성적단백.대CH1F적단백서렬용BlastP진행수색화분석,제시타응해시DEAD합가족적일개eIF-4A동원단백;용DNAStar장기여허다전형적DEAD합단백서렬진행비대분석,결과현시:비기기타적DEAD합단백,타여eIF-4A혹eIF-4A적동원단백구유경고적동원성화경다서렬상적상사결구역.장포함완정열독광적편단아극륭진표체재체pET-28a(+),재대장간균DH5α중표체,산생적융합단백대소재45 kD좌우.대해융합단백진행순화、중신절첩화초보감정.ATP매활성검측현시,해융합단백지유흔저적ATP매활성,이차타적ATP매활성사호불의뢰우핵산저물.대저일검측결과급출3충가능적원인.저일검측결과여근거서렬분석득도적추론--CH1F단백가능시일개eIF-4A병불모순.
Eukaryotic initiation factor 4A (eIF-4A), a prototype of the DEAD-box family of ATP-dependent RNA helicases, plays a pivotal role in the initiation of protein synthesis in eukaryotic systems. CH1 F, the full-length cDNA of a putative eIF-4A, was isolated by screening the cDNA library of Plasmodium cynomolgi,and then expressed in E. coli DHSα. CH1 F is composed of 1753 bp including the ORF of 1197 bp encoding a protein of 398 amino acid residues. Alignment analyses indicated that the deduced protein sequence was much more similar to other eIF-4As than other DEAD-box proteins. The recombinant protein of about 45 kD was purified, refolded and characterized. The ATPase assay showed that ATPase activity of the fusion protein was very low and seemed independent of nucleic acids. Here are three possible explanations for the results,and the results have no contradictions with the assumption that CH1F is an eIF-4A, derived from alignment analyses.