热带海洋学报
熱帶海洋學報
열대해양학보
JOURNAL OF TROPICAL OCEANOGRAPHY
2007年
3期
48-52
,共5页
任岗%章群%钱开诚%徐忠能%林小涛
任崗%章群%錢開誠%徐忠能%林小濤
임강%장군%전개성%서충능%림소도
石鲈科%线粒体16S rRNA 基因%RNA二级结构%序列分析%系统发育
石鱸科%線粒體16S rRNA 基因%RNA二級結構%序列分析%繫統髮育
석로과%선립체16S rRNA 기인%RNA이급결구%서렬분석%계통발육
分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16S rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区.结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息.从序列的Jukes-Cantor遗传距离结果看,石鲈科胡椒鲷属Plectorhynchus、矶鲈属Parapristipoma、石鲈属Hapalogenys、髭鲷属Pomadasys、Haemulon属5个属属间的差异水平都接近或超过了其与外类群科间的差异水平.从构建的ME系统发育树结果看,石鲈科鱼类分成二大分支,未能形成单一类群.在亲缘关系上,胡椒鲷属和矶鲈属较近,石鲈属和Haemulon属较近,髭鲷属与其它4个属较远,髭鲷属在鲈亚目中的分类地位可能应提高到科的水平.初步确定研究中选用的16S rRNA基因片段基本适用于石鲈科属间和属内种间关系的研究.
分析瞭5屬12種石鱸科魚類的線粒體16S rRNA基因部分序列特徵,併參照RNA二級結構模型區分配對區和非配對區.結果錶明,配對區對G有偏好(33.5%),非配對區對A有偏好(38.5%);與配對區相比,非配對區存在更多的變異和繫統髮育信息.從序列的Jukes-Cantor遺傳距離結果看,石鱸科鬍椒鯛屬Plectorhynchus、磯鱸屬Parapristipoma、石鱸屬Hapalogenys、髭鯛屬Pomadasys、Haemulon屬5箇屬屬間的差異水平都接近或超過瞭其與外類群科間的差異水平.從構建的ME繫統髮育樹結果看,石鱸科魚類分成二大分支,未能形成單一類群.在親緣關繫上,鬍椒鯛屬和磯鱸屬較近,石鱸屬和Haemulon屬較近,髭鯛屬與其它4箇屬較遠,髭鯛屬在鱸亞目中的分類地位可能應提高到科的水平.初步確定研究中選用的16S rRNA基因片段基本適用于石鱸科屬間和屬內種間關繫的研究.
분석료5속12충석로과어류적선립체16S rRNA기인부분서렬특정,병삼조RNA이급결구모형구분배대구화비배대구.결과표명,배대구대G유편호(33.5%),비배대구대A유편호(38.5%);여배대구상비,비배대구존재경다적변이화계통발육신식.종서렬적Jukes-Cantor유전거리결과간,석로과호초조속Plectorhynchus、기로속Parapristipoma、석로속Hapalogenys、자조속Pomadasys、Haemulon속5개속속간적차이수평도접근혹초과료기여외류군과간적차이수평.종구건적ME계통발육수결과간,석로과어류분성이대분지,미능형성단일류군.재친연관계상,호초조속화기로속교근,석로속화Haemulon속교근,자조속여기타4개속교원,자조속재로아목중적분류지위가능응제고도과적수평.초보학정연구중선용적16S rRNA기인편단기본괄용우석로과속간화속내충간관계적연구.