中山大学学报（自然科学版）
中山大學學報（自然科學版）
중산대학학보（자연과학판）
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2011年
2期
87-92
,共6页
高峰%李防震%王珺%董骝焕
高峰%李防震%王珺%董騮煥
고봉%리방진%왕군%동류환
多序列比对%置换距离%最长公共子序%进化距离
多序列比對%置換距離%最長公共子序%進化距離
다서렬비대%치환거리%최장공공자서%진화거리
蛋白质多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着重要的应用.各种比对算法在这个领域都取得了很大的成功,但是每种算法都有其固有的缺陷.提出置换距离法,对当前流行的几种蛋白质多序列比对算法进行对比评价.由于置换距离法仅关注于不同蛋白质间进化距离的相对次序,而不考虑这些进化距离之间的细微差异,因而得到的评价结论更具有鲁棒性.另外,采用最长公共子序法度量置换距离可以比较准确的反映不同置换之间的差异性.基于该算法,对Dialign,Tcoffee,ClustalW和Muscle多序列比对算法进行了性能评估.
蛋白質多序列比對是一種重要的生物信息學工具,在生物的進化分析以及蛋白質的結構預測方麵有著重要的應用.各種比對算法在這箇領域都取得瞭很大的成功,但是每種算法都有其固有的缺陷.提齣置換距離法,對噹前流行的幾種蛋白質多序列比對算法進行對比評價.由于置換距離法僅關註于不同蛋白質間進化距離的相對次序,而不攷慮這些進化距離之間的細微差異,因而得到的評價結論更具有魯棒性.另外,採用最長公共子序法度量置換距離可以比較準確的反映不同置換之間的差異性.基于該算法,對Dialign,Tcoffee,ClustalW和Muscle多序列比對算法進行瞭性能評估.
단백질다서렬비대시일충중요적생물신식학공구,재생물적진화분석이급단백질적결구예측방면유착중요적응용.각충비대산법재저개영역도취득료흔대적성공,단시매충산법도유기고유적결함.제출치환거리법,대당전류행적궤충단백질다서렬비대산법진행대비평개.유우치환거리법부관주우불동단백질간진화거리적상대차서,이불고필저사진화거리지간적세미차이,인이득도적평개결론경구유로봉성.령외,채용최장공공자서법도량치환거리가이비교준학적반영불동치환지간적차이성.기우해산법,대Dialign,Tcoffee,ClustalW화Muscle다서렬비대산법진행료성능평고.
