曲阜师范大学学报（自然科学版）
麯阜師範大學學報（自然科學版）
곡부사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF QUFU NORMAL UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE EDITION)
2011年
2期
84-88
,共5页
黑线姬鼠%OPN%序列结构%系统进化
黑線姬鼠%OPN%序列結構%繫統進化
흑선희서%OPN%서렬결구%계통진화
以近缘种OPN的cDNA序列为参考设计引物,通过RT-PCR得到黑线姬鼠OPN部分序列,并将得到的cDNA序列翻译成氨基酸序列,注册到GenBank(登陆号:HM626723).利用该序列构建系统进化树,同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级结构预测.结果表明:克隆得到的209 bp OPN的序列,包括部分外显子4,全部的外显子5及部分外显子6;该段序列从第二个碱基开始翻译,共编码69个氨基酸;其一级结构中包括了一个由10个连续天冬氨酸组成的高度酸性区域,它对骨桥蛋白与羟基磷灰石之间的联系具有重要意义;二级结构中大部分为а螺旋,且具有亲水性;利用所得OPN序列构建的系统进化树显示黑线姬鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与鸡、鹌鹑亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致,本研究所得到的OPN序列将有助于对骨桥蛋白的作用机制研究及系统进行分析.
以近緣種OPN的cDNA序列為參攷設計引物,通過RT-PCR得到黑線姬鼠OPN部分序列,併將得到的cDNA序列翻譯成氨基痠序列,註冊到GenBank(登陸號:HM626723).利用該序列構建繫統進化樹,同時對其編碼的蛋白質進行一級結構分析及二級結構預測.結果錶明:剋隆得到的209 bp OPN的序列,包括部分外顯子4,全部的外顯子5及部分外顯子6;該段序列從第二箇堿基開始翻譯,共編碼69箇氨基痠;其一級結構中包括瞭一箇由10箇連續天鼕氨痠組成的高度痠性區域,它對骨橋蛋白與羥基燐灰石之間的聯繫具有重要意義;二級結構中大部分為а螺鏇,且具有親水性;利用所得OPN序列構建的繫統進化樹顯示黑線姬鼠與大鼠、小鼠親緣關繫最近,與鷄、鵪鶉親緣關繫最遠,此結果與物種的進化關繫相一緻,本研究所得到的OPN序列將有助于對骨橋蛋白的作用機製研究及繫統進行分析.
이근연충OPN적cDNA서렬위삼고설계인물,통과RT-PCR득도흑선희서OPN부분서렬,병장득도적cDNA서렬번역성안기산서렬,주책도GenBank(등륙호:HM626723).이용해서렬구건계통진화수,동시대기편마적단백질진행일급결구분석급이급결구예측.결과표명:극륭득도적209 bp OPN적서렬,포괄부분외현자4,전부적외현자5급부분외현자6;해단서렬종제이개감기개시번역,공편마69개안기산;기일급결구중포괄료일개유10개련속천동안산조성적고도산성구역,타대골교단백여간기린회석지간적련계구유중요의의;이급결구중대부분위а라선,차구유친수성;이용소득OPN서렬구건적계통진화수현시흑선희서여대서、소서친연관계최근,여계、암순친연관계최원,차결과여물충적진화관계상일치,본연구소득도적OPN서렬장유조우대골교단백적작용궤제연구급계통진행분석.
