中国农业科学
中國農業科學
중국농업과학
SCIENTIA AGRICULTURA SINICA
2006年
6期
1083-1090
,共8页
蓝伟侦%何光存%吴士筠%覃瑞
藍偉偵%何光存%吳士筠%覃瑞
람위정%하광존%오사균%담서
C0t-1 DNA%CGH%核型%药用野生稻%疣粒野生稻
C0t-1 DNA%CGH%覈型%藥用野生稻%疣粒野生稻
C0t-1 DNA%CGH%핵형%약용야생도%우립야생도
[目的]研究中高度重复序列在稻属不同物种基因组进化中的作用.[方法]用栽培稻C0t-1 DNA和基因组DNA(gDNA)作为探针,分别对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻进行荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交(CGH).[结果]C0t-1 DNA覆盖栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组比例(%)和大小(Mb)分别为47.10±0.16,38.61±0.13,44.38±0.13和212.33±1.21,269.42±0.89以及532.56±1.68.栽培稻gDNA在药用野生稻和疣粒野生稻基因组中的覆盖率约为91.0%和93.6%,含量分别约为634 Mb和1123 Mb,各有365 Mb和591 Mb不属于源自栽培稻基因组的中高度重复序列,未被栽培稻gDNA所覆盖的部分,分别为64 Mb和78 Mb左右.此外,以C0t-1 DNA的组成为依据,对这3个种核型进行了同源性聚类.[结论]稻属中度和高度重复序列和功能基因一样,在不同种中也存在着高度同源性和保守性,并在进化过程中得以保存下来.药用野生稻和疣粒野生稻基因组增大的重要原因之一,可能是基因组中度和高度重复序列加倍的结果,药用野生稻这种序列扩增相对疣粒野生稻要缓和得多.另外,这两个野生种在长期进化过程中,由于存在加倍、重排和基因选择性丢失等现象,形成了具有自己种的特异性的基因组成分.
[目的]研究中高度重複序列在稻屬不同物種基因組進化中的作用.[方法]用栽培稻C0t-1 DNA和基因組DNA(gDNA)作為探針,分彆對栽培稻、藥用野生稻和疣粒野生稻進行熒光原位雜交(FISH)和比較基因組雜交(CGH).[結果]C0t-1 DNA覆蓋栽培稻、藥用野生稻和疣粒野生稻基因組比例(%)和大小(Mb)分彆為47.10±0.16,38.61±0.13,44.38±0.13和212.33±1.21,269.42±0.89以及532.56±1.68.栽培稻gDNA在藥用野生稻和疣粒野生稻基因組中的覆蓋率約為91.0%和93.6%,含量分彆約為634 Mb和1123 Mb,各有365 Mb和591 Mb不屬于源自栽培稻基因組的中高度重複序列,未被栽培稻gDNA所覆蓋的部分,分彆為64 Mb和78 Mb左右.此外,以C0t-1 DNA的組成為依據,對這3箇種覈型進行瞭同源性聚類.[結論]稻屬中度和高度重複序列和功能基因一樣,在不同種中也存在著高度同源性和保守性,併在進化過程中得以保存下來.藥用野生稻和疣粒野生稻基因組增大的重要原因之一,可能是基因組中度和高度重複序列加倍的結果,藥用野生稻這種序列擴增相對疣粒野生稻要緩和得多.另外,這兩箇野生種在長期進化過程中,由于存在加倍、重排和基因選擇性丟失等現象,形成瞭具有自己種的特異性的基因組成分.
[목적]연구중고도중복서렬재도속불동물충기인조진화중적작용.[방법]용재배도C0t-1 DNA화기인조DNA(gDNA)작위탐침,분별대재배도、약용야생도화우립야생도진행형광원위잡교(FISH)화비교기인조잡교(CGH).[결과]C0t-1 DNA복개재배도、약용야생도화우립야생도기인조비례(%)화대소(Mb)분별위47.10±0.16,38.61±0.13,44.38±0.13화212.33±1.21,269.42±0.89이급532.56±1.68.재배도gDNA재약용야생도화우립야생도기인조중적복개솔약위91.0%화93.6%,함량분별약위634 Mb화1123 Mb,각유365 Mb화591 Mb불속우원자재배도기인조적중고도중복서렬,미피재배도gDNA소복개적부분,분별위64 Mb화78 Mb좌우.차외,이C0t-1 DNA적조성위의거,대저3개충핵형진행료동원성취류.[결론]도속중도화고도중복서렬화공능기인일양,재불동충중야존재착고도동원성화보수성,병재진화과정중득이보존하래.약용야생도화우립야생도기인조증대적중요원인지일,가능시기인조중도화고도중복서렬가배적결과,약용야생도저충서렬확증상대우립야생도요완화득다.령외,저량개야생충재장기진화과정중,유우존재가배、중배화기인선택성주실등현상,형성료구유자기충적특이성적기인조성분.