动物学杂志
動物學雜誌
동물학잡지
CHINESE JOURNAL OF ZOOLOGY
2009年
2期
97-101
,共5页
付小全%曾柳根%洪一江%盛军庆%王军花%桂建芳
付小全%曾柳根%洪一江%盛軍慶%王軍花%桂建芳
부소전%증류근%홍일강%성군경%왕군화%계건방
萍乡肉红鲫%线粒体%Cyt b基因%序列分析
萍鄉肉紅鯽%線粒體%Cyt b基因%序列分析
평향육홍즉%선립체%Cyt b기인%서렬분석
用细胞色素b(Cyt b)基因特异性引物,对萍乡肉红鲫(Carassius auratus var.pingxiangnensis)的线粒体Cyl b基因进行PCR扩增和双向测序.在12个个体中均得到序列一致的Cyt b基因全序列,长度为1 140 bp.其A、T、G、C含量分别为28.2%(321)、28.8%(328)、14.8%(170)和28.2%(321),A+T含量(57%)明显高于G+C含量(43%).与其他水生动物相同基因片段碱基含量相似.该基因中密码子第1位核苷酸中4种碱基组成较为均衡;第2位核苷酸中T的使用率较高,为41.8%,G的使用率较低,为13.2%;密码子第3位A的使用率较高,为39.7%,而G的使用率较低,仅为6.3%.BLAST结果显示,萍乡肉红鲫与其他鲫鱼类的Cyt b基因具有较高的同源性,其中与银鲫(C.a.gibelio)的相似性为93%,与普通鲫鱼(C.carassius)的相似性为98%.邻接法构建的分子系统进化树表明,萍乡肉红鲫与普通鲫鱼亲缘关系最近.
用細胞色素b(Cyt b)基因特異性引物,對萍鄉肉紅鯽(Carassius auratus var.pingxiangnensis)的線粒體Cyl b基因進行PCR擴增和雙嚮測序.在12箇箇體中均得到序列一緻的Cyt b基因全序列,長度為1 140 bp.其A、T、G、C含量分彆為28.2%(321)、28.8%(328)、14.8%(170)和28.2%(321),A+T含量(57%)明顯高于G+C含量(43%).與其他水生動物相同基因片段堿基含量相似.該基因中密碼子第1位覈苷痠中4種堿基組成較為均衡;第2位覈苷痠中T的使用率較高,為41.8%,G的使用率較低,為13.2%;密碼子第3位A的使用率較高,為39.7%,而G的使用率較低,僅為6.3%.BLAST結果顯示,萍鄉肉紅鯽與其他鯽魚類的Cyt b基因具有較高的同源性,其中與銀鯽(C.a.gibelio)的相似性為93%,與普通鯽魚(C.carassius)的相似性為98%.鄰接法構建的分子繫統進化樹錶明,萍鄉肉紅鯽與普通鯽魚親緣關繫最近.
용세포색소b(Cyt b)기인특이성인물,대평향육홍즉(Carassius auratus var.pingxiangnensis)적선립체Cyl b기인진행PCR확증화쌍향측서.재12개개체중균득도서렬일치적Cyt b기인전서렬,장도위1 140 bp.기A、T、G、C함량분별위28.2%(321)、28.8%(328)、14.8%(170)화28.2%(321),A+T함량(57%)명현고우G+C함량(43%).여기타수생동물상동기인편단감기함량상사.해기인중밀마자제1위핵감산중4충감기조성교위균형;제2위핵감산중T적사용솔교고,위41.8%,G적사용솔교저,위13.2%;밀마자제3위A적사용솔교고,위39.7%,이G적사용솔교저,부위6.3%.BLAST결과현시,평향육홍즉여기타즉어류적Cyt b기인구유교고적동원성,기중여은즉(C.a.gibelio)적상사성위93%,여보통즉어(C.carassius)적상사성위98%.린접법구건적분자계통진화수표명,평향육홍즉여보통즉어친연관계최근.
