甲型流感病毒H5N1的siRNA设计
갑형류감병독H5N1적siRNA설계
siRNA DESIGN TO THE H5N1 SUBTYPE OF INFLUENZA A VIRUS
  • 万方数据
    应用与环境生物学报 응용여배경생물학보
    CHINESE JOURNAL OF APPLIED & ENVIRONMENTAL BIOLOGY
    2004年 1期 133-138 ,共6页

    郭骁才%郭红霞

    곽효재%곽홍하

    甲型流感病毒%H5N1亚型%siRNA%sRNAFinder计算机程序%系统发育重建%计算机筛选 甲型流感病毒%H5N1亞型%siRNA%sRNAFinder計算機程序%繫統髮育重建%計算機篩選
    갑형류감병독%H5N1아형%siRNA%sRNAFinder계산궤정서%계통발육중건%계산궤사선
    选用了甲型流感病毒10个毒株(全序列)和一个2004年越南毒株(部分序列), 采用自己编写的计算机程序sRNAFinder, 对每个毒株的6个RNA片段的6个编码序列进行了siRNA设计. 结合系统发育重建方法, 利用sRNAFinder的共有序列分析功能, 对得到的6101个siRNA分子进行了计算机筛选. 结果表明, 设计的siRNA的分子, 针对np和pb1应该是最有效的, 而针对ha和na的siRNA分子设计, 需要疾病流行期毒株的最新测序数据; 从ns1的数据不能获得很保守的、可作为预防或治疗药物的siRNA分子. 图1 表4 参16
    선용료갑형류감병독10개독주(전서렬)화일개2004년월남독주(부분서렬), 채용자기편사적계산궤정서sRNAFinder, 대매개독주적6개RNA편단적6개편마서렬진행료siRNA설계. 결합계통발육중건방법, 이용sRNAFinder적공유서렬분석공능, 대득도적6101개siRNA분자진행료계산궤사선. 결과표명, 설계적siRNA적분자, 침대np화pb1응해시최유효적, 이침대ha화na적siRNA분자설계, 수요질병류행기독주적최신측서수거; 종ns1적수거불능획득흔보수적、가작위예방혹치료약물적siRNA분자. 도1 표4 삼16
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