黑龙江农业科学
黑龍江農業科學
흑룡강농업과학
HEILONGJINAG AGRICULTURAL SCIENCE
2009年
6期
4-8
,共5页
李德军%邓治%陈春柳%陈守才
李德軍%鄧治%陳春柳%陳守纔
리덕군%산치%진춘류%진수재
巴西橡胶树%核糖体蛋白S6%基因克隆%序列分析
巴西橡膠樹%覈糖體蛋白S6%基因剋隆%序列分析
파서상효수%핵당체단백S6%기인극륭%서렬분석
Hevea brasiliensis%ribosomal protein S6%gene cloning%sequence analysis
核糖体蛋白S6是核糖体蛋白家族的重要成员,在核糖体中发挥重要作用.利用农业部橡胶生物学重点开放实验室获得的部分序列设计引物,采用3′-RACE技术从巴西橡胶树胶乳中获得一个核糖体蛋白S6基因的完整阅读框,该基因编码249个氨基酸的多肽,含有一个典型的真核生物核糖体蛋白S6结构域.在HbRPS6氨基酸序列中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明:HbRPS6属于混合型蛋白.对10个RPS6系统进化分析表明:巴西橡胶树的RPS6基因在进化上具有保守性,与植物类玉米的RPS5基因亲缘关系最近,而与动物和酵母的亲缘关系相对较远.该基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础.
覈糖體蛋白S6是覈糖體蛋白傢族的重要成員,在覈糖體中髮揮重要作用.利用農業部橡膠生物學重點開放實驗室穫得的部分序列設計引物,採用3′-RACE技術從巴西橡膠樹膠乳中穫得一箇覈糖體蛋白S6基因的完整閱讀框,該基因編碼249箇氨基痠的多肽,含有一箇典型的真覈生物覈糖體蛋白S6結構域.在HbRPS6氨基痠序列中沒有預測到跨膜區和信號肽,二級結構分析錶明:HbRPS6屬于混閤型蛋白.對10箇RPS6繫統進化分析錶明:巴西橡膠樹的RPS6基因在進化上具有保守性,與植物類玉米的RPS5基因親緣關繫最近,而與動物和酵母的親緣關繫相對較遠.該基因的剋隆和生物信息學分析為深入研究其功能奠定瞭基礎.
핵당체단백S6시핵당체단백가족적중요성원,재핵당체중발휘중요작용.이용농업부상효생물학중점개방실험실획득적부분서렬설계인물,채용3′-RACE기술종파서상효수효유중획득일개핵당체단백S6기인적완정열독광,해기인편마249개안기산적다태,함유일개전형적진핵생물핵당체단백S6결구역.재HbRPS6안기산서렬중몰유예측도과막구화신호태,이급결구분석표명:HbRPS6속우혼합형단백.대10개RPS6계통진화분석표명:파서상효수적RPS6기인재진화상구유보수성,여식물류옥미적RPS5기인친연관계최근,이여동물화효모적친연관계상대교원.해기인적극륭화생물신식학분석위심입연구기공능전정료기출.
The ribosomal protein S6 is the key member of ribosomal protein family,and it plays an important role in the ribosomal proteins.The primers designed based on the known sequences acquired from Key Laboratory of Rubber Bidoye of Minisby of Agriculture,the gene was cloned with 3'-RACE technique from Hevea brasiliensis latex.The open reading frame encoded 249 amino acids,containing a conserved ribosomal S6 domain,so the gene was named as HbRPS6.No signal peptide and transmembrane structure were predicted within HbRPS6.The result of secondary structure predicted showed that the protein was classified as mixed type.The result of phylogenetic tree indicated that HbRPS6 displayed a high degree of sequence similarity to ZmRPS5,but not to animals and yeast.This paper will be benefit to further analyze the functions of HbRPS6.