水生生物学报
水生生物學報
수생생물학보
ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA
2011年
4期
672-680
,共9页
湖北钉螺%肝胰腺%cDNA文库%EST
湖北釘螺%肝胰腺%cDNA文庫%EST
호북정라%간이선%cDNA문고%EST
以湖北钉螺肝胰腺为材料构建cDNA文库.文库初始滴度为5.6×104cfu/mL,库容量为6.72×105cfu/mL,重组率为93％.插入片段长度为400-2700bp.对其中1728个克隆进行测序,得到1520个序列,其中长度大于100 bp的ESTs为1393条,初步拼接得到698个单基因簇(Unigene),其中包括234个重叠群(Contig),464个单拷贝(Singleton)EST.使用BLAST软件进行同源性分析,结果显示有111个单基因簇具有不同程度的同源性,约占15.90％；587个单基因簇与所有已发现的蛋白质的基因没有或者有着相当低的同源性,约占84.10％.研究为湖北钉螺的基因学研究提供了重要的基础资料,同时亦为筛选和鉴定湖北钉螺生长发育、免疫等相关的功能基因以及血吸虫与螺之间的相互关系奠定了基础.
以湖北釘螺肝胰腺為材料構建cDNA文庫.文庫初始滴度為5.6×104cfu/mL,庫容量為6.72×105cfu/mL,重組率為93％.插入片段長度為400-2700bp.對其中1728箇剋隆進行測序,得到1520箇序列,其中長度大于100 bp的ESTs為1393條,初步拼接得到698箇單基因簇(Unigene),其中包括234箇重疊群(Contig),464箇單拷貝(Singleton)EST.使用BLAST軟件進行同源性分析,結果顯示有111箇單基因簇具有不同程度的同源性,約佔15.90％；587箇單基因簇與所有已髮現的蛋白質的基因沒有或者有著相噹低的同源性,約佔84.10％.研究為湖北釘螺的基因學研究提供瞭重要的基礎資料,同時亦為篩選和鑒定湖北釘螺生長髮育、免疫等相關的功能基因以及血吸蟲與螺之間的相互關繫奠定瞭基礎.
이호북정라간이선위재료구건cDNA문고.문고초시적도위5.6×104cfu/mL,고용량위6.72×105cfu/mL,중조솔위93％.삽입편단장도위400-2700bp.대기중1728개극륭진행측서,득도1520개서렬,기중장도대우100 bp적ESTs위1393조,초보병접득도698개단기인족(Unigene),기중포괄234개중첩군(Contig),464개단고패(Singleton)EST.사용BLAST연건진행동원성분석,결과현시유111개단기인족구유불동정도적동원성,약점15.90％；587개단기인족여소유이발현적단백질적기인몰유혹자유착상당저적동원성,약점84.10％.연구위호북정라적기인학연구제공료중요적기출자료,동시역위사선화감정호북정라생장발육、면역등상관적공능기인이급혈흡충여라지간적상호관계전정료기출.
