CAJ | 학술논문

目的本研究旨在通过对猪甲型H1N1流感病毒进行序列信息分析的基础上,利用焦磷酸测序技术建立一种快速、简单地确证猪甲型H1N1流感病毒的方法.方法通过序列信息比对,设计H1HA和N1NA基因保守区段的扩增引物及测序引物.从感染猪甲型H1N1病毒的鸡胚尿囊液中提取病毒RNA,RT-PCR扩增目的基因片段,采用焦磷酸测序技术(PSQ)针对HA基因和NA基因进行保守核苷酸区段的测序分析.利用扩增引物与其他猪源病毒进行特异性试验,利用测序引物进行重复性试验.将该方法与病毒分离和荧光定量RT-PCR方法做临床样品的平行检测,并比较结果.结果通过序列信息比对寻找到表征H1N1亚型的核苷酸保守区段,经焦磷酸测序后能进一步确证毒株的序列信息为猪甲型H1N1流感病毒.特异性试验表明,不与其他猪源病毒发生交叉反应;重复性试验表明,重现性为100%.对221份临床样品检测表明,病毒分离鉴定与焦磷酸测序方法结果符合率为96.8%,与TaqMan荧光定量方法检测结果符合率90.3%.经统计学分析,焦磷酸测序确证与病毒分离鉴定在检测临床样品上,两者差异不显著.结论基于序列分析的焦磷酸测序技术可以作为进一步确证方法使用.
목적본연구지재통과대저갑형H1N1류감병독진행서렬신식분석적기출상,이용초린산측서기술건립일충쾌속、간단지학증저갑형H1N1류감병독적방법.방법통과서렬신식비대,설계H1HA화N1NA기인보수구단적확증인물급측서인물.종감염저갑형H1N1병독적계배뇨낭액중제취병독RNA,RT-PCR확증목적기인편단,채용초린산측서기술(PSQ)침대HA기인화NA기인진행보수핵감산구단적측서분석.이용확증인물여기타저원병독진행특이성시험,이용측서인물진행중복성시험.장해방법여병독분리화형광정량RT-PCR방법주림상양품적평행검측,병비교결과.결과통과서렬신식비대심조도표정H1N1아형적핵감산보수구단,경초린산측서후능진일보학증독주적서렬신식위저갑형H1N1류감병독.특이성시험표명,불여기타저원병독발생교차반응;중복성시험표명,중현성위100%.대221빈림상양품검측표명,병독분리감정여초린산측서방법결과부합솔위96.8%,여TaqMan형광정량방법검측결과부합솔90.3%.경통계학분석,초린산측서학증여병독분리감정재검측림상양품상,량자차이불현저.결론기우서렬분석적초린산측서기술가이작위진일보학증방법사용.