CAJ | 학술논문

ESTs数据库的发展为分子标记的开发提供了宝贵的资源.本研究从NCBI下载与杨树木质部形成相关的5 359条ESTs序列,在其中257条序列中检测到279个SSRs位点,检出率为5.2%.全部SSRs共分为84种重复单元,平均长度18.2 bp,变幅为15～36 bp,平均分布频率1/6.94 kb.所有类型中三核苷酸重复单元占总SSRs的41.3%,处于主导地位.AAG占三核苷酸重复单元的比例为27.0%,是三核苷酸重复单元中的优势重复类型.利用primer3在线设计引物,通过生物信息学方法筛选出7对引物,其中6对扩增效果较好.利用筛选出的引物对19个杨树无性系进行扩增,每对引物产生多态性条带数目为3～6条,平均4.16条.引物多态信息量变化范围为0.226 7～0.984 5,平均0.548 5.应用NTSYS软件在相似系数为0.68水平可将19个杨树无性系准确聚类.研究结果表明,利用ESTs序列进行SSRs的开发是一种切实有效的方法,为EST-SSRs在杨树遗传图谱构建以及遗传多样性等方面的应用奠定了基础
ESTs수거고적발전위분자표기적개발제공료보귀적자원.본연구종NCBI하재여양수목질부형성상관적5 359조ESTs서렬,재기중257조서렬중검측도279개SSRs위점,검출솔위5.2%.전부SSRs공분위84충중복단원,평균장도18.2 bp,변폭위15～36 bp,평균분포빈솔1/6.94 kb.소유류형중삼핵감산중복단원점총SSRs적41.3%,처우주도지위.AAG점삼핵감산중복단원적비례위27.0%,시삼핵감산중복단원중적우세중복류형.이용primer3재선설계인물,통과생물신식학방법사선출7대인물,기중6대확증효과교호.이용사선출적인물대19개양수무성계진행확증,매대인물산생다태성조대수목위3～6조,평균4.16조.인물다태신식량변화범위위0.226 7～0.984 5,평균0.548 5.응용NTSYS연건재상사계수위0.68수평가장19개양수무성계준학취류.연구결과표명,이용ESTs서렬진행SSRs적개발시일충절실유효적방법,위EST-SSRs재양수유전도보구건이급유전다양성등방면적응용전정료기출