癌症
癌癥
암증
CHINESE JOURNAL OF CANCER
2008年
1期
1-7
,共7页
陈霞%马文丽%梁爽%廖之君%商涛%郑文岭
陳霞%馬文麗%樑爽%廖之君%商濤%鄭文嶺
진하%마문려%량상%료지군%상도%정문령
鼻咽肿瘤/病因学%EB病毒%复发感染%基因表达谱%差异基因
鼻嚥腫瘤/病因學%EB病毒%複髮感染%基因錶達譜%差異基因
비인종류/병인학%EB병독%복발감염%기인표체보%차이기인
背景与目的:EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染在鼻咽癌发生中发挥重要作用.本研究的目的在于探讨潜伏的EBV活化后形成的复发感染对鼻咽癌发生过程中全基因组表达的影响.方法:收集EBV阳性(EBV+)/EBV阴性(EBV-)的鼻咽癌靶标基因表达谱和EBV复发感染次数不同的鼻咽癌细胞株基因表达谱,通过生物信息学手段对其进行交叉比较,统计学分析筛选出25个差异基因.运用DAVID(database for annotation,visualization and integrated discovery)、pSTIING(protein,signaling,transcriptional interactions and inflammation networks gateway)、GATHER(gene annotation tool to help explain relationships)和TELiS(transcription element listening system)在线分析工具对25个共同差异基因进行表达模式的预测.结果:与EBV初次感染时的基因表达谱比较,仅有DUSP1、TOP1、HOXA9、DEK、IMPDH2、PABPC1等25个基因在EBV复发感染时仍然呈明显差异表达;这25个差异基因及其相关转录因子主要通过2种模式相互作用:一条主要涉及TOP1、DUSP1、DUSP6和RPS28等,另一条是由PITX1、CD9、HOXA9和IMPDH2组成的转录相关环.结论:EBV潜伏后的复发感染,可能通过筛选到的差异基因的2种表达模式发挥功能,最终导致鼻咽癌的发生.
揹景與目的:EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染在鼻嚥癌髮生中髮揮重要作用.本研究的目的在于探討潛伏的EBV活化後形成的複髮感染對鼻嚥癌髮生過程中全基因組錶達的影響.方法:收集EBV暘性(EBV+)/EBV陰性(EBV-)的鼻嚥癌靶標基因錶達譜和EBV複髮感染次數不同的鼻嚥癌細胞株基因錶達譜,通過生物信息學手段對其進行交扠比較,統計學分析篩選齣25箇差異基因.運用DAVID(database for annotation,visualization and integrated discovery)、pSTIING(protein,signaling,transcriptional interactions and inflammation networks gateway)、GATHER(gene annotation tool to help explain relationships)和TELiS(transcription element listening system)在線分析工具對25箇共同差異基因進行錶達模式的預測.結果:與EBV初次感染時的基因錶達譜比較,僅有DUSP1、TOP1、HOXA9、DEK、IMPDH2、PABPC1等25箇基因在EBV複髮感染時仍然呈明顯差異錶達;這25箇差異基因及其相關轉錄因子主要通過2種模式相互作用:一條主要涉及TOP1、DUSP1、DUSP6和RPS28等,另一條是由PITX1、CD9、HOXA9和IMPDH2組成的轉錄相關環.結論:EBV潛伏後的複髮感染,可能通過篩選到的差異基因的2種錶達模式髮揮功能,最終導緻鼻嚥癌的髮生.
배경여목적:EB병독(Epstein-Barr virus,EBV)감염재비인암발생중발휘중요작용.본연구적목적재우탐토잠복적EBV활화후형성적복발감염대비인암발생과정중전기인조표체적영향.방법:수집EBV양성(EBV+)/EBV음성(EBV-)적비인암파표기인표체보화EBV복발감염차수불동적비인암세포주기인표체보,통과생물신식학수단대기진행교차비교,통계학분석사선출25개차이기인.운용DAVID(database for annotation,visualization and integrated discovery)、pSTIING(protein,signaling,transcriptional interactions and inflammation networks gateway)、GATHER(gene annotation tool to help explain relationships)화TELiS(transcription element listening system)재선분석공구대25개공동차이기인진행표체모식적예측.결과:여EBV초차감염시적기인표체보비교,부유DUSP1、TOP1、HOXA9、DEK、IMPDH2、PABPC1등25개기인재EBV복발감염시잉연정명현차이표체;저25개차이기인급기상관전록인자주요통과2충모식상호작용:일조주요섭급TOP1、DUSP1、DUSP6화RPS28등,령일조시유PITX1、CD9、HOXA9화IMPDH2조성적전록상관배.결론:EBV잠복후적복발감염,가능통과사선도적차이기인적2충표체모식발휘공능,최종도치비인암적발생.