中国海洋大学学报(自然科学版)
中國海洋大學學報(自然科學版)
중국해양대학학보(자연과학판)
PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2007年
6期
951-956
,共6页
乔利仙%翁曼丽%孔凡娜%戴继勋%王斌
喬利仙%翁曼麗%孔凡娜%戴繼勛%王斌
교리선%옹만려%공범나%대계훈%왕빈
紫菜%多样性%种质%鉴定%RSAP
紫菜%多樣性%種質%鑒定%RSAP
자채%다양성%충질%감정%RSAP
限制性位点扩增多态性(restriction site amplification polymorphism,RSAP)是根据基因组内普遍存在的酶切位点来设计特殊的引物,通过简单的梯度PCR反应来产生多态性.本研究首次将RSAP标记技术成功应用于紫菜遗传多样性检测和种质鉴定.利用所建立的适合于紫菜RSAP分析的PCR反应体系和反应条件,使用30对引物对15个紫菜系DNA进行了PCR扩增,经过3次重复验证,有12对引物能够扩增出清晰且稳定的条带.这12对引物共扩增出413条带,其中408条为多态性条带,多态性比例96%,平均每对引物产生34条多态性条带,片段大小在50~500 bp之间.利用这413条带进行聚类分析,产生了这15个紫菜系的进化树.15个紫菜系在0.69相似系数水平上分为两大类:一类包括坛紫菜;另一类包括条斑紫菜和少精紫菜.选2对引物R1/R6和R3/R4所扩增的10条稳定且重复性好的条带,构建了这15个紫菜系的RSAP-DNA指纹图谱.在该指纹图谱中,每个紫菜系都有其独一无二的指纹模式,能够很容易地与其它紫菜系相区分.
限製性位點擴增多態性(restriction site amplification polymorphism,RSAP)是根據基因組內普遍存在的酶切位點來設計特殊的引物,通過簡單的梯度PCR反應來產生多態性.本研究首次將RSAP標記技術成功應用于紫菜遺傳多樣性檢測和種質鑒定.利用所建立的適閤于紫菜RSAP分析的PCR反應體繫和反應條件,使用30對引物對15箇紫菜繫DNA進行瞭PCR擴增,經過3次重複驗證,有12對引物能夠擴增齣清晰且穩定的條帶.這12對引物共擴增齣413條帶,其中408條為多態性條帶,多態性比例96%,平均每對引物產生34條多態性條帶,片段大小在50~500 bp之間.利用這413條帶進行聚類分析,產生瞭這15箇紫菜繫的進化樹.15箇紫菜繫在0.69相似繫數水平上分為兩大類:一類包括罈紫菜;另一類包括條斑紫菜和少精紫菜.選2對引物R1/R6和R3/R4所擴增的10條穩定且重複性好的條帶,構建瞭這15箇紫菜繫的RSAP-DNA指紋圖譜.在該指紋圖譜中,每箇紫菜繫都有其獨一無二的指紋模式,能夠很容易地與其它紫菜繫相區分.
한제성위점확증다태성(restriction site amplification polymorphism,RSAP)시근거기인조내보편존재적매절위점래설계특수적인물,통과간단적제도PCR반응래산생다태성.본연구수차장RSAP표기기술성공응용우자채유전다양성검측화충질감정.이용소건립적괄합우자채RSAP분석적PCR반응체계화반응조건,사용30대인물대15개자채계DNA진행료PCR확증,경과3차중복험증,유12대인물능구확증출청석차은정적조대.저12대인물공확증출413조대,기중408조위다태성조대,다태성비례96%,평균매대인물산생34조다태성조대,편단대소재50~500 bp지간.이용저413조대진행취류분석,산생료저15개자채계적진화수.15개자채계재0.69상사계수수평상분위량대류:일류포괄단자채;령일류포괄조반자채화소정자채.선2대인물R1/R6화R3/R4소확증적10조은정차중복성호적조대,구건료저15개자채계적RSAP-DNA지문도보.재해지문도보중,매개자채계도유기독일무이적지문모식,능구흔용역지여기타자채계상구분.