重庆师范大学学报（自然科学版）
重慶師範大學學報（自然科學版）
중경사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF CHONGQING NORMAL UNIVERSITY（NATURAL SCIENCE EDITION）
2012年
6期
80-86,封三
,共8页
王瑞雪%沈亮余%赵敬会%李荣冲%郑小敏%张涛
王瑞雪%瀋亮餘%趙敬會%李榮遲%鄭小敏%張濤
왕서설%침량여%조경회%리영충%정소민%장도
白菜%防御素%基因重复%进化
白菜%防禦素%基因重複%進化
백채%방어소%기인중복%진화
采用生物信息学的方法,通过已知防御素基因家族基因氨基酸序列在线Blast相似性比对,对白菜(Brassica rapa)基因组中防御素基因进行了预测和鉴定,分析了防御素基因在进化过程中各部分结构,包括上游区域、启动子区域、外显子区域、内含子区域以及UTR区域的结构变异以及功能变异,对该基因上游序列顺式作用元件和表达模式进行了预测.分析结果表明,白菜防御素基因编码60～80个氨基酸短肽,编码氨基酸均具有8个保守的半胱氧酸；白菜防御素基因功能结构域保持相对稳定,但部分基因成员前端信号肽序列出现变异；内含子长度出现增长、缩短、消失等3种变异模式；该基因上游启动子区域核苷酸变异较其他区域显著,上游序列顺式作用元件大多与光应答、逆境胁迫应答和信号分子应答相关.该基因表达模式预测结果表明白菜防御素基因在进化过程中可能出现分化,主要体现在基因沉默和表达部位的差异.
採用生物信息學的方法,通過已知防禦素基因傢族基因氨基痠序列在線Blast相似性比對,對白菜(Brassica rapa)基因組中防禦素基因進行瞭預測和鑒定,分析瞭防禦素基因在進化過程中各部分結構,包括上遊區域、啟動子區域、外顯子區域、內含子區域以及UTR區域的結構變異以及功能變異,對該基因上遊序列順式作用元件和錶達模式進行瞭預測.分析結果錶明,白菜防禦素基因編碼60～80箇氨基痠短肽,編碼氨基痠均具有8箇保守的半胱氧痠；白菜防禦素基因功能結構域保持相對穩定,但部分基因成員前耑信號肽序列齣現變異；內含子長度齣現增長、縮短、消失等3種變異模式；該基因上遊啟動子區域覈苷痠變異較其他區域顯著,上遊序列順式作用元件大多與光應答、逆境脅迫應答和信號分子應答相關.該基因錶達模式預測結果錶明白菜防禦素基因在進化過程中可能齣現分化,主要體現在基因沉默和錶達部位的差異.
채용생물신식학적방법,통과이지방어소기인가족기인안기산서렬재선Blast상사성비대,대백채(Brassica rapa)기인조중방어소기인진행료예측화감정,분석료방어소기인재진화과정중각부분결구,포괄상유구역、계동자구역、외현자구역、내함자구역이급UTR구역적결구변이이급공능변이,대해기인상유서렬순식작용원건화표체모식진행료예측.분석결과표명,백채방어소기인편마60～80개안기산단태,편마안기산균구유8개보수적반광양산；백채방어소기인공능결구역보지상대은정,단부분기인성원전단신호태서렬출현변이；내함자장도출현증장、축단、소실등3충변이모식；해기인상유계동자구역핵감산변이교기타구역현저,상유서렬순식작용원건대다여광응답、역경협박응답화신호분자응답상관.해기인표체모식예측결과표명백채방어소기인재진화과정중가능출현분화,주요체현재기인침묵화표체부위적차이.
