乐山师范学院学报
樂山師範學院學報
악산사범학원학보
JOURNAL OF LESHAN TEACHERS COLLEGE
2004年
12期
64-67
,共4页
胡建平%廖金花%张知锦%弓加文
鬍建平%廖金花%張知錦%弓加文
호건평%료금화%장지금%궁가문
谷氨酰胺结合蛋白%分子动力学模拟%构象开合
穀氨酰胺結閤蛋白%分子動力學模擬%構象開閤
곡안선알결합단백%분자동역학모의%구상개합
从谷氨酰胺结合蛋白单体(GlnBp)和谷氨酰胺结合蛋白复合物(GlnBP-Gln)的晶体结构出发分别做600ps的对比分子动力学(MD)实验.从体系的分子结构,铰链区柔性和口袋区相互作用三个方面分析了该体系的构象开合机制.结果表明,构象闭合直接导致了体积收缩;复合物铰链区的较大柔性赋予构象闭合以结构基础;其中His156、Lys115、Ala67三个残基对于GlnBP特异性结合底物Gln起着重要作用,而Lys115和Asp10的相互作用对于构象的闭合十分重要,这些模拟结果与实验数据相吻合.
從穀氨酰胺結閤蛋白單體(GlnBp)和穀氨酰胺結閤蛋白複閤物(GlnBP-Gln)的晶體結構齣髮分彆做600ps的對比分子動力學(MD)實驗.從體繫的分子結構,鉸鏈區柔性和口袋區相互作用三箇方麵分析瞭該體繫的構象開閤機製.結果錶明,構象閉閤直接導緻瞭體積收縮;複閤物鉸鏈區的較大柔性賦予構象閉閤以結構基礎;其中His156、Lys115、Ala67三箇殘基對于GlnBP特異性結閤底物Gln起著重要作用,而Lys115和Asp10的相互作用對于構象的閉閤十分重要,這些模擬結果與實驗數據相吻閤.
종곡안선알결합단백단체(GlnBp)화곡안선알결합단백복합물(GlnBP-Gln)적정체결구출발분별주600ps적대비분자동역학(MD)실험.종체계적분자결구,교련구유성화구대구상호작용삼개방면분석료해체계적구상개합궤제.결과표명,구상폐합직접도치료체적수축;복합물교련구적교대유성부여구상폐합이결구기출;기중His156、Lys115、Ala67삼개잔기대우GlnBP특이성결합저물Gln기착중요작용,이Lys115화Asp10적상호작용대우구상적폐합십분중요,저사모의결과여실험수거상문합.
