中国海洋大学学报(自然科学版)
中國海洋大學學報(自然科學版)
중국해양대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2004年
1期
75-83
,共9页
苟万里%刘东艳%甄毓%辛泽毓%李荣秀%于志刚
茍萬裏%劉東豔%甄毓%辛澤毓%李榮秀%于誌剛
구만리%류동염%견육%신택육%리영수%우지강
rDNA%ITS%裸甲藻%序列相似性%系统树%共生甲藻%浮游植物
rDNA%ITS%裸甲藻%序列相似性%繫統樹%共生甲藻%浮遊植物
rDNA%ITS%라갑조%서렬상사성%계통수%공생갑조%부유식물
测定了1株分离自青岛胶州湾海水样品、从形态上初步确定为裸甲藻属(Gymnodinium sp, 编号为GYN-15)的核糖体基因(rDNA)和转录单元内间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS)序列,并利用该序列对该藻进行了初步鉴定.测定的序列长2 658 bp,涵盖了小亚基(small subunit, SSU) rDNA基因3'端1 747 bp,ITS1-5.8S rDNA-ITS2全长和大亚基(large subunit, LSU) rDNA基因5'端337 bp.同源性分析该序列发现GYN-15与共生甲藻属(Symbiodinium)中的2个种(Symbiodinium californium和Gymnodinium varians)的对应序列具有很高的相似性;3株藻的各段rDNA和ITS序列的相似性均为99%以上;以SSU rDNA序列中的3个可变区(V1+V2+V3)和邻接法构建的系统树表明,GYN-15与S. californium和G. varians构成1个独立的新的子类群,该子类群属于共生甲藻属,而与各种裸甲藻的亲缘关系较远.根据这些结果可将GYN-15初步鉴定为属于共生甲藻属.鉴于GYN-15和其它2个种所构成的分支明显与5个已知的子类群(A,B,C,D,E)不同,因此将该分支命名为子类群F.
測定瞭1株分離自青島膠州灣海水樣品、從形態上初步確定為裸甲藻屬(Gymnodinium sp, 編號為GYN-15)的覈糖體基因(rDNA)和轉錄單元內間隔區(Internal Transcribed Spacer, ITS)序列,併利用該序列對該藻進行瞭初步鑒定.測定的序列長2 658 bp,涵蓋瞭小亞基(small subunit, SSU) rDNA基因3'耑1 747 bp,ITS1-5.8S rDNA-ITS2全長和大亞基(large subunit, LSU) rDNA基因5'耑337 bp.同源性分析該序列髮現GYN-15與共生甲藻屬(Symbiodinium)中的2箇種(Symbiodinium californium和Gymnodinium varians)的對應序列具有很高的相似性;3株藻的各段rDNA和ITS序列的相似性均為99%以上;以SSU rDNA序列中的3箇可變區(V1+V2+V3)和鄰接法構建的繫統樹錶明,GYN-15與S. californium和G. varians構成1箇獨立的新的子類群,該子類群屬于共生甲藻屬,而與各種裸甲藻的親緣關繫較遠.根據這些結果可將GYN-15初步鑒定為屬于共生甲藻屬.鑒于GYN-15和其它2箇種所構成的分支明顯與5箇已知的子類群(A,B,C,D,E)不同,因此將該分支命名為子類群F.
측정료1주분리자청도효주만해수양품、종형태상초보학정위라갑조속(Gymnodinium sp, 편호위GYN-15)적핵당체기인(rDNA)화전록단원내간격구(Internal Transcribed Spacer, ITS)서렬,병이용해서렬대해조진행료초보감정.측정적서렬장2 658 bp,함개료소아기(small subunit, SSU) rDNA기인3'단1 747 bp,ITS1-5.8S rDNA-ITS2전장화대아기(large subunit, LSU) rDNA기인5'단337 bp.동원성분석해서렬발현GYN-15여공생갑조속(Symbiodinium)중적2개충(Symbiodinium californium화Gymnodinium varians)적대응서렬구유흔고적상사성;3주조적각단rDNA화ITS서렬적상사성균위99%이상;이SSU rDNA서렬중적3개가변구(V1+V2+V3)화린접법구건적계통수표명,GYN-15여S. californium화G. varians구성1개독립적신적자류군,해자류군속우공생갑조속,이여각충라갑조적친연관계교원.근거저사결과가장GYN-15초보감정위속우공생갑조속.감우GYN-15화기타2개충소구성적분지명현여5개이지적자류군(A,B,C,D,E)불동,인차장해분지명명위자류군F.
