我国登革3型病毒广西80-2株基因组全序列分析
아국등혁3형병독엄서80-2주기인조전서렬분석
Analysis of Complete Genomic Sequence of the Dengue Type 3 Virus 80-2 Strain Isolated from Guangxi in China
  • 万方数据
    中国生物化学与分子生物学报 중국생물화학여분자생물학보
    CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
    2001年 5期 621-625 ,共5页

    苑锡同%耿丽卿%于曼%胡志君%赵卫%陈水平%王鹏程%范宝昌%杨佩英%秦鄂德

    원석동%경려경%우만%호지군%조위%진수평%왕붕정%범보창%양패영%진악덕

    登革3型病毒%广西株%全序列分析 登革3型病毒%廣西株%全序列分析
    등혁3형병독%엄서주%전서렬분석
    对我国登革3型病毒80-2株基因组进行全序列测定,为了解其基因组结构与功能的关系提供依据.根据登革3型病毒H87株的序列设计并合成引物,应用RT-PCR和RACE法,对80-2株基因组RNA进行扩增、克隆测序后获得我国登革3型病毒广西株基因组序列.该株病毒基因组全长10 696 nt,不含poly(A)尾,4种碱基数分别为A:3 437,C:2 215,G:2 773,U:2 271.包含一个读码框架,自95至10 267位,共10 170个碱基,编码3 390个氨基酸,5′和3′非编码区长度分别为94 nt和432 nt.与H 87株比较,核苷酸和氨基酸序列同源性均在99%以上,有28个碱基发生改变,其中26个碱基突变发生在读码框架内,碱基转换18个,颠换10个;碱基突变引起14个氨基酸的改变.80-2株与H87株病毒的基因组全序列同源性高,变异度小.
    대아국등혁3형병독80-2주기인조진행전서렬측정,위료해기기인조결구여공능적관계제공의거.근거등혁3형병독H87주적서렬설계병합성인물,응용RT-PCR화RACE법,대80-2주기인조RNA진행확증、극륭측서후획득아국등혁3형병독엄서주기인조서렬.해주병독기인조전장10 696 nt,불함poly(A)미,4충감기수분별위A:3 437,C:2 215,G:2 773,U:2 271.포함일개독마광가,자95지10 267위,공10 170개감기,편마3 390개안기산,5′화3′비편마구장도분별위94 nt화432 nt.여H 87주비교,핵감산화안기산서렬동원성균재99%이상,유28개감기발생개변,기중26개감기돌변발생재독마광가내,감기전환18개,전환10개;감기돌변인기14개안기산적개변.80-2주여H87주병독적기인조전서렬동원성고,변이도소.
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