生物物理学报
生物物理學報
생물물이학보
ACTA BIOPHYSICA SINICA
2001年
1期
174-180
,共7页
张静%顾宝洪%石秀凡%刘次全
張靜%顧寶洪%石秀凡%劉次全
장정%고보홍%석수범%류차전
蛋白质二级结构%mRNA%密码子前后碱基使用偏向%同义密码子
蛋白質二級結構%mRNA%密碼子前後堿基使用偏嚮%同義密碼子
단백질이급결구%mRNA%밀마자전후감기사용편향%동의밀마자
对一组E.coli基因中编码蛋白质各类二级结构(α-螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折)的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较,发现一些密码子前后碱基的使用有偏向,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦表明,E.coli基因中同义密码子的选用与蛋白质的二级结构有一些关联。模型对于蛋白质结构预测算法的改进以及基因工程的研究有辅助作用。
對一組E.coli基因中編碼蛋白質各類二級結構(α-螺鏇、β-摺疊片、無規捲麯和迴摺)的密碼子前後堿基的使用情況進行統計分析和比較,髮現一些密碼子前後堿基的使用有偏嚮,而且這些偏嚮與蛋白質的二級結構有關聯。這同時亦錶明,E.coli基因中同義密碼子的選用與蛋白質的二級結構有一些關聯。模型對于蛋白質結構預測算法的改進以及基因工程的研究有輔助作用。
대일조E.coli기인중편마단백질각류이급결구(α-라선、β-절첩편、무규권곡화회절)적밀마자전후감기적사용정황진행통계분석화비교,발현일사밀마자전후감기적사용유편향,이차저사편향여단백질적이급결구유관련。저동시역표명,E.coli기인중동의밀마자적선용여단백질적이급결구유일사관련。모형대우단백질결구예측산법적개진이급기인공정적연구유보조작용。
The context base usages of codons encoding for differentsecondary structures(a-helix,b-sheet,coil and turn)of protein in aset of Escherichia coligenes were statistically analysed and compared.Tr is concluded that hte context base usages of several codons are biased and the biases seem to be related to the secondary structures of synonymous codons and the secondary structures of protein in E.coligenes.The model in this paper may be useful for predicting algorithms of secondary structure of protein and gene engineering researching.