生物医学工程学杂志
生物醫學工程學雜誌
생물의학공정학잡지
2002年
3期
455-458
,共4页
吴晓明%宋长新%王波%程敬之
吳曉明%宋長新%王波%程敬之
오효명%송장신%왕파%정경지
隐马尔可夫模型%SCOP数据库%蛋白质分类%序列分析
隱馬爾可伕模型%SCOP數據庫%蛋白質分類%序列分析
은마이가부모형%SCOP수거고%단백질분류%서렬분석
隐马尔可夫模型(Hidden Markov model,HMM)用于蛋白质研究是生物信息学研究的新领域.目前,人们已经得到大量的蛋白质序列和结构数据,传统研究蛋白质的方法已经不再实用,生物学家已经转向能够处理大量数据的统计方法来进行研究.隐马尔可夫模型可以通过训练,识别同一特征的蛋白质序列.从SCOP数据库中选择了一个蛋白质族,由它得到了能够代表该族特征的隐马尔可夫模型,并用该模型对一些蛋白质序列进行分析.结果表明,HMM能够较好的表示同一族的蛋白质,并能够从许多蛋白质序列中识别出该族的蛋白质序列.
隱馬爾可伕模型(Hidden Markov model,HMM)用于蛋白質研究是生物信息學研究的新領域.目前,人們已經得到大量的蛋白質序列和結構數據,傳統研究蛋白質的方法已經不再實用,生物學傢已經轉嚮能夠處理大量數據的統計方法來進行研究.隱馬爾可伕模型可以通過訓練,識彆同一特徵的蛋白質序列.從SCOP數據庫中選擇瞭一箇蛋白質族,由它得到瞭能夠代錶該族特徵的隱馬爾可伕模型,併用該模型對一些蛋白質序列進行分析.結果錶明,HMM能夠較好的錶示同一族的蛋白質,併能夠從許多蛋白質序列中識彆齣該族的蛋白質序列.
은마이가부모형(Hidden Markov model,HMM)용우단백질연구시생물신식학연구적신영역.목전,인문이경득도대량적단백질서렬화결구수거,전통연구단백질적방법이경불재실용,생물학가이경전향능구처리대량수거적통계방법래진행연구.은마이가부모형가이통과훈련,식별동일특정적단백질서렬.종SCOP수거고중선택료일개단백질족,유타득도료능구대표해족특정적은마이가부모형,병용해모형대일사단백질서렬진행분석.결과표명,HMM능구교호적표시동일족적단백질,병능구종허다단백질서렬중식별출해족적단백질서렬.
