西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2008年
1期
7-11
,共5页
赵利民%陈夫贵%巩振辉%赵会芳%柯桂兰
趙利民%陳伕貴%鞏振輝%趙會芳%柯桂蘭
조이민%진부귀%공진휘%조회방%가계란
大白菜%细胞质雄性不育%生物信息学%orf75
大白菜%細胞質雄性不育%生物信息學%orf75
대백채%세포질웅성불육%생물신식학%orf75
根据orf138的保守序列设计引物,以大白菜萝卜胞质雄性不育系RC7的mtDNA为模板进行PCR扩增,扩增出大小为588 bp的特异条带,该片段在叶片和花蕾中均有表达,没有转录后加工,可编码75个氨基酸,定名为orf15.同源性分析结果表明:orf75推导的氨基酸序列N末端与萝卜 Ogu CMS所具有的ORF138一致性为100%,有28个氨基酸完全相同,C末端与钾依赖钠钙交换蛋白-1一致性为54%.初步认为,orf75可能是orf138与钾依赖钠钙交换蛋白-1的编码基因发生重排产生的新的开放阅读框.RC7的不育性与Ogu CMS具有相似性.该588 bp片段还可编码1个含有1个疏水基团和1个跨膜区的67aa的蛋白片段,定名为orf67,属可溶性蛋白.
根據orf138的保守序列設計引物,以大白菜蘿蔔胞質雄性不育繫RC7的mtDNA為模闆進行PCR擴增,擴增齣大小為588 bp的特異條帶,該片段在葉片和花蕾中均有錶達,沒有轉錄後加工,可編碼75箇氨基痠,定名為orf15.同源性分析結果錶明:orf75推導的氨基痠序列N末耑與蘿蔔 Ogu CMS所具有的ORF138一緻性為100%,有28箇氨基痠完全相同,C末耑與鉀依賴鈉鈣交換蛋白-1一緻性為54%.初步認為,orf75可能是orf138與鉀依賴鈉鈣交換蛋白-1的編碼基因髮生重排產生的新的開放閱讀框.RC7的不育性與Ogu CMS具有相似性.該588 bp片段還可編碼1箇含有1箇疏水基糰和1箇跨膜區的67aa的蛋白片段,定名為orf67,屬可溶性蛋白.
근거orf138적보수서렬설계인물,이대백채라복포질웅성불육계RC7적mtDNA위모판진행PCR확증,확증출대소위588 bp적특이조대,해편단재협편화화뢰중균유표체,몰유전록후가공,가편마75개안기산,정명위orf15.동원성분석결과표명:orf75추도적안기산서렬N말단여라복 Ogu CMS소구유적ORF138일치성위100%,유28개안기산완전상동,C말단여갑의뢰납개교환단백-1일치성위54%.초보인위,orf75가능시orf138여갑의뢰납개교환단백-1적편마기인발생중배산생적신적개방열독광.RC7적불육성여Ogu CMS구유상사성.해588 bp편단환가편마1개함유1개소수기단화1개과막구적67aa적단백편단,정명위orf67,속가용성단백.
