作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2011年
1期
40-47
,共8页
董佳%蔡彩平%王立科%赵亮%张天真%郭旺珍
董佳%蔡綵平%王立科%趙亮%張天真%郭旺珍
동가%채채평%왕립과%조량%장천진%곽왕진
内切-1,4-β-葡聚糖酶%1,3-β-葡聚糖酶%结构%表达
內切-1,4-β-葡聚糖酶%1,3-β-葡聚糖酶%結構%錶達
내절-1,4-β-포취당매%1,3-β-포취당매%결구%표체
β-葡聚糖酶是一类能降解β-葡聚糖的水解酶.本研究分别通过电子克降和棉纤维发育cDNA文库筛选法克隆到2个棉花β-葡聚糖酶新基因,内切-1,4-β-葡聚糖酶基因(GhEG,GenBank登录号为HM462003)和1,3-β-葡聚糖酶基因(GhGLU,GenBank登录号为HM462004).GhEG全长ORF为1581 bp,编码526个氨基酸残基.GhGLU全长ORF为1 410 bp,编码469个氨基酸残基.基因组水平分析表明,GhEG含5个内含子和6个外显子.而GhGLU无内含子,仅1个外显子.新克隆的2个基因在二倍体棉种非洲棉和雷蒙德氏棉中含1个拷贝,而在四倍体陆地棉和海岛棉中存在2个拷贝.通过开发SNP标记分别将GhEG和GhGLU在四倍体中的1个拷贝定位在第19染色体和第4染色体上.Q-PCR表达分析表明,GhEG在根、茎、叶中表达水平很低,而在纤维伸长期优势表达.在15 DPA和20 DPA纤维中,该基因在海岛棉海7124中的转录本显著高于陆地棉TM-1.GhGLU在根、茎、叶及纤维发育不同时期均有表达,属于组成性表达基因,特别在根、纤维发育初始期和伸长后期优势表达,且表达水平在陆地棉TM-1和海岛棉海7124间也有显著差异.
β-葡聚糖酶是一類能降解β-葡聚糖的水解酶.本研究分彆通過電子剋降和棉纖維髮育cDNA文庫篩選法剋隆到2箇棉花β-葡聚糖酶新基因,內切-1,4-β-葡聚糖酶基因(GhEG,GenBank登錄號為HM462003)和1,3-β-葡聚糖酶基因(GhGLU,GenBank登錄號為HM462004).GhEG全長ORF為1581 bp,編碼526箇氨基痠殘基.GhGLU全長ORF為1 410 bp,編碼469箇氨基痠殘基.基因組水平分析錶明,GhEG含5箇內含子和6箇外顯子.而GhGLU無內含子,僅1箇外顯子.新剋隆的2箇基因在二倍體棉種非洲棉和雷矇德氏棉中含1箇拷貝,而在四倍體陸地棉和海島棉中存在2箇拷貝.通過開髮SNP標記分彆將GhEG和GhGLU在四倍體中的1箇拷貝定位在第19染色體和第4染色體上.Q-PCR錶達分析錶明,GhEG在根、莖、葉中錶達水平很低,而在纖維伸長期優勢錶達.在15 DPA和20 DPA纖維中,該基因在海島棉海7124中的轉錄本顯著高于陸地棉TM-1.GhGLU在根、莖、葉及纖維髮育不同時期均有錶達,屬于組成性錶達基因,特彆在根、纖維髮育初始期和伸長後期優勢錶達,且錶達水平在陸地棉TM-1和海島棉海7124間也有顯著差異.
β-포취당매시일류능강해β-포취당적수해매.본연구분별통과전자극강화면섬유발육cDNA문고사선법극륭도2개면화β-포취당매신기인,내절-1,4-β-포취당매기인(GhEG,GenBank등록호위HM462003)화1,3-β-포취당매기인(GhGLU,GenBank등록호위HM462004).GhEG전장ORF위1581 bp,편마526개안기산잔기.GhGLU전장ORF위1 410 bp,편마469개안기산잔기.기인조수평분석표명,GhEG함5개내함자화6개외현자.이GhGLU무내함자,부1개외현자.신극륭적2개기인재이배체면충비주면화뢰몽덕씨면중함1개고패,이재사배체륙지면화해도면중존재2개고패.통과개발SNP표기분별장GhEG화GhGLU재사배체중적1개고패정위재제19염색체화제4염색체상.Q-PCR표체분석표명,GhEG재근、경、협중표체수평흔저,이재섬유신장기우세표체.재15 DPA화20 DPA섬유중,해기인재해도면해7124중적전록본현저고우륙지면TM-1.GhGLU재근、경、협급섬유발육불동시기균유표체,속우조성성표체기인,특별재근、섬유발육초시기화신장후기우세표체,차표체수평재륙지면TM-1화해도면해7124간야유현저차이.
