南昌大学学报（理科版）
南昌大學學報（理科版）
남창대학학보（이과판）
JOURNAL OF NANCHANG UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2011年
3期
284-287,295
,共5页
朱必凤%杨旭夫%彭凌%韦昭玉
硃必鳳%楊旭伕%彭凌%韋昭玉
주필봉%양욱부%팽릉%위소옥
副猪嗜血杆菌%看家基因%多基因位点分析%序列分型
副豬嗜血桿菌%看傢基因%多基因位點分析%序列分型
부저기혈간균%간가기인%다기인위점분석%서렬분형
对副猪嗜血杆菌86个分离株的7个看家基因,包括ATP合成酶β链(atpD)、翻译起始因子IF-2(in-fB)、核糖体蛋白β亚基(rpoB)、苹果酸脱氢酶(mdh)、6-磷酸葡萄糖脱氢酶(6pgd)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(g3pd)和延胡索酸还原酶B(frdB)进行了PCR扩增;对扩增产物进行了测序;对序列编辑、队列比对、建立MLST定义、等位基因序列文件等,与牛津大学动物系Keith Jolley合作建立了副猪嗜血杆菌86个分离株的MLST数据库.经MLST分析发现所研究的分离株有高度的遗传异源性,86个菌株被分成74个序列类型.基因平均距离为0.674,IA=0.804.每个基因位点存在64～76不等数目的等位基因.基因序列多态性位点最大(fedB)达325和(6pgd)219,最小(infB)为77;用UPGMA分析确定了5个菌群.
對副豬嗜血桿菌86箇分離株的7箇看傢基因,包括ATP閤成酶β鏈(atpD)、翻譯起始因子IF-2(in-fB)、覈糖體蛋白β亞基(rpoB)、蘋果痠脫氫酶(mdh)、6-燐痠葡萄糖脫氫酶(6pgd)、3-燐痠甘油醛脫氫酶(g3pd)和延鬍索痠還原酶B(frdB)進行瞭PCR擴增;對擴增產物進行瞭測序;對序列編輯、隊列比對、建立MLST定義、等位基因序列文件等,與牛津大學動物繫Keith Jolley閤作建立瞭副豬嗜血桿菌86箇分離株的MLST數據庫.經MLST分析髮現所研究的分離株有高度的遺傳異源性,86箇菌株被分成74箇序列類型.基因平均距離為0.674,IA=0.804.每箇基因位點存在64～76不等數目的等位基因.基因序列多態性位點最大(fedB)達325和(6pgd)219,最小(infB)為77;用UPGMA分析確定瞭5箇菌群.
대부저기혈간균86개분리주적7개간가기인,포괄ATP합성매β련(atpD)、번역기시인자IF-2(in-fB)、핵당체단백β아기(rpoB)、평과산탈경매(mdh)、6-린산포도당탈경매(6pgd)、3-린산감유철탈경매(g3pd)화연호색산환원매B(frdB)진행료PCR확증;대확증산물진행료측서;대서렬편집、대렬비대、건립MLST정의、등위기인서렬문건등,여우진대학동물계Keith Jolley합작건립료부저기혈간균86개분리주적MLST수거고.경MLST분석발현소연구적분리주유고도적유전이원성,86개균주피분성74개서렬류형.기인평균거리위0.674,IA=0.804.매개기인위점존재64～76불등수목적등위기인.기인서렬다태성위점최대(fedB)체325화(6pgd)219,최소(infB)위77;용UPGMA분석학정료5개균군.
