畜牧与兽医
畜牧與獸醫
축목여수의
ANIMAL HUSBANDRY & VETERINARY MEDICINE
2011年
9期
57-61
,共5页
马友记%黄连清%柳纪省%张利
馬友記%黃連清%柳紀省%張利
마우기%황련청%류기성%장리
猪繁殖与呼吸综合征病毒%ORF1%克隆%同源性%变异
豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒%ORF1%剋隆%同源性%變異
저번식여호흡종합정병독%ORF1%극륭%동원성%변이
根据GenBank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) VR-2332毒株基因序列设计合成了9对引物,采用RT-PCR方法对PRRSV GS株的非结构蛋白基因ORF1进行了分子克隆,并对其核苷酸序列及编码氨基酸进行了分析.结果表明:ORF1全长ll 882 bp,其中ORF1a核苷酸长7 512bp,编码2 503个氨基酸,ORF1b核苷酸长4 374 bp,编码1 457个氨基酸.PRRSV GS株ORF1基因与VR-2332株ORF1基因核苷酸同源性较高,其中ORF1a为89.3％,ORF1b为90.7％,而与LV株同源性相比较低,其同源性分别为54.3％和60.8％,相对ORF1a来说,ORFlb较为保守.ORF1编码的产物为2个聚合蛋白,ORF1a所编码的聚合蛋白经水解酶切割后产生6个成熟的非结构蛋白(NSP),其中NSP2变异最大,该蛋白具有耐受碱基插入、突变的能力,可能与PRRSV对组织细胞的亲嗜性有关；ORFlb编码的聚合蛋白经蛋白酶切割后,产生4个成熟的非结构蛋白.从系统发生树分析,PRRSV GS株非结构蛋白基因区域在基因型上属于北美洲型.
根據GenBank中豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒(PRRSV) VR-2332毒株基因序列設計閤成瞭9對引物,採用RT-PCR方法對PRRSV GS株的非結構蛋白基因ORF1進行瞭分子剋隆,併對其覈苷痠序列及編碼氨基痠進行瞭分析.結果錶明:ORF1全長ll 882 bp,其中ORF1a覈苷痠長7 512bp,編碼2 503箇氨基痠,ORF1b覈苷痠長4 374 bp,編碼1 457箇氨基痠.PRRSV GS株ORF1基因與VR-2332株ORF1基因覈苷痠同源性較高,其中ORF1a為89.3％,ORF1b為90.7％,而與LV株同源性相比較低,其同源性分彆為54.3％和60.8％,相對ORF1a來說,ORFlb較為保守.ORF1編碼的產物為2箇聚閤蛋白,ORF1a所編碼的聚閤蛋白經水解酶切割後產生6箇成熟的非結構蛋白(NSP),其中NSP2變異最大,該蛋白具有耐受堿基插入、突變的能力,可能與PRRSV對組織細胞的親嗜性有關；ORFlb編碼的聚閤蛋白經蛋白酶切割後,產生4箇成熟的非結構蛋白.從繫統髮生樹分析,PRRSV GS株非結構蛋白基因區域在基因型上屬于北美洲型.
근거GenBank중저번식여호흡종합정병독(PRRSV) VR-2332독주기인서렬설계합성료9대인물,채용RT-PCR방법대PRRSV GS주적비결구단백기인ORF1진행료분자극륭,병대기핵감산서렬급편마안기산진행료분석.결과표명:ORF1전장ll 882 bp,기중ORF1a핵감산장7 512bp,편마2 503개안기산,ORF1b핵감산장4 374 bp,편마1 457개안기산.PRRSV GS주ORF1기인여VR-2332주ORF1기인핵감산동원성교고,기중ORF1a위89.3％,ORF1b위90.7％,이여LV주동원성상비교저,기동원성분별위54.3％화60.8％,상대ORF1a래설,ORFlb교위보수.ORF1편마적산물위2개취합단백,ORF1a소편마적취합단백경수해매절할후산생6개성숙적비결구단백(NSP),기중NSP2변이최대,해단백구유내수감기삽입、돌변적능력,가능여PRRSV대조직세포적친기성유관；ORFlb편마적취합단백경단백매절할후,산생4개성숙적비결구단백.종계통발생수분석,PRRSV GS주비결구단백기인구역재기인형상속우북미주형.
