表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析
표피포도구균쌍조분조공계통적생물신식학분석
  • 万方数据
    科学通报 과학통보
    CHINESE SCIENCE BULLETIN
    2004年 10期 948-952 ,共5页

    秦智强%钟扬%张健%何有裕%吴旸%江娟%陈洁敏%罗小民%瞿涤

    진지강%종양%장건%하유유%오양%강연%진길민%라소민%구조

    表皮葡萄球菌%双组分调控系统%组氨酸蛋白激酶%反应调节蛋白%生物信息学%药物靶标 錶皮葡萄毬菌%雙組分調控繫統%組氨痠蛋白激酶%反應調節蛋白%生物信息學%藥物靶標
    표피포도구균%쌍조분조공계통%조안산단백격매%반응조절단백%생물신식학%약물파표
    应用序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段, 从表皮葡萄球菌全基因组序列中发现16对双组分调控系统以及2个相对保守的功能域(HATPase_c和REC). 通过与金黄色葡萄球菌和枯草杆菌中的双组分调控系统基因比较, 预测表皮葡萄球菌中同源双组分调控系统基因可能具有参与调控细菌生长、生物膜形成、毒力因子表达等重要生物学功能. 对16对双组分调控系统基因的2个保守性功能域进行空间结构模建, 获得4个相似的组氨酸蛋白激酶HATPase_c功能域模拟结构以及13个相似的反应调节蛋白REC功能域模拟结构, 其中HATPase_c结构在AMP-PNP的结合部位形成袋状结构, 而REC结构中均包含3个天冬氨酸活性位点. 初步实验结果表明表皮葡萄球菌双组分调控系统保守性功能域的生物信息学分析可以为进一步开发相关治疗药物提供潜在的靶标.
    응용서렬동원성비교급공능역분석등생물신식학수단, 종표피포도구균전기인조서렬중발현16대쌍조분조공계통이급2개상대보수적공능역(HATPase_c화REC). 통과여금황색포도구균화고초간균중적쌍조분조공계통기인비교, 예측표피포도구균중동원쌍조분조공계통기인가능구유삼여조공세균생장、생물막형성、독력인자표체등중요생물학공능. 대16대쌍조분조공계통기인적2개보수성공능역진행공간결구모건, 획득4개상사적조안산단백격매HATPase_c공능역모의결구이급13개상사적반응조절단백REC공능역모의결구, 기중HATPase_c결구재AMP-PNP적결합부위형성대상결구, 이REC결구중균포함3개천동안산활성위점. 초보실험결과표명표피포도구균쌍조분조공계통보수성공능역적생물신식학분석가이위진일보개발상관치료약물제공잠재적파표.
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