西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2012年
3期
454-464
,共11页
李伟%韩蕾%钱永强%巨关升%孙振元
李偉%韓蕾%錢永彊%巨關升%孫振元
리위%한뢰%전영강%거관승%손진원
非生物逆境%NAC转录因子%生物信息学
非生物逆境%NAC轉錄因子%生物信息學
비생물역경%NAC전록인자%생물신식학
通过生物信息学手段,对22种NAC蛋白(14种非生物逆境胁迫相关NAC蛋白、8种涉及不同生物学功能的NAC蛋白)进行氨基酸序列比对和系统发生树构建,对14种非生物逆境胁迫相关NAC蛋白氨基酸组成、理化性质、亲/疏水性、保守结构域、亚细胞定位、二级结构及三级结构等进行了分析、预测.结果显示,22个NAC蛋白中,非生物逆境相关的NAC蛋白聚成一类,其余NAC蛋白聚为另一类；非生物逆境胁迫相关的NAC蛋白序列分析显示,N-端具有A、B、C、D、E5个保守的亚结构域,共同组成NAC结构域,C-端含有多个保守的酸性氨基酸位点,具有转录激活功能,同时蛋白中含有多个丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)磷酸化位点；非生物逆境胁迫相关NAC蛋白主要亲水区域位于A、C、D亚域,大多定位于细胞核,个别定位于细胞质或线粒体,二级结构则以α-螺旋和β-折叠片为主；拟南芥RD26和ANAC三级结构上的一致性暗示了功能上的相似.
通過生物信息學手段,對22種NAC蛋白(14種非生物逆境脅迫相關NAC蛋白、8種涉及不同生物學功能的NAC蛋白)進行氨基痠序列比對和繫統髮生樹構建,對14種非生物逆境脅迫相關NAC蛋白氨基痠組成、理化性質、親/疏水性、保守結構域、亞細胞定位、二級結構及三級結構等進行瞭分析、預測.結果顯示,22箇NAC蛋白中,非生物逆境相關的NAC蛋白聚成一類,其餘NAC蛋白聚為另一類；非生物逆境脅迫相關的NAC蛋白序列分析顯示,N-耑具有A、B、C、D、E5箇保守的亞結構域,共同組成NAC結構域,C-耑含有多箇保守的痠性氨基痠位點,具有轉錄激活功能,同時蛋白中含有多箇絲氨痠(S)、囌氨痠(T)和酪氨痠(Y)燐痠化位點；非生物逆境脅迫相關NAC蛋白主要親水區域位于A、C、D亞域,大多定位于細胞覈,箇彆定位于細胞質或線粒體,二級結構則以α-螺鏇和β-摺疊片為主；擬南芥RD26和ANAC三級結構上的一緻性暗示瞭功能上的相似.
통과생물신식학수단,대22충NAC단백(14충비생물역경협박상관NAC단백、8충섭급불동생물학공능적NAC단백)진행안기산서렬비대화계통발생수구건,대14충비생물역경협박상관NAC단백안기산조성、이화성질、친/소수성、보수결구역、아세포정위、이급결구급삼급결구등진행료분석、예측.결과현시,22개NAC단백중,비생물역경상관적NAC단백취성일류,기여NAC단백취위령일류；비생물역경협박상관적NAC단백서렬분석현시,N-단구유A、B、C、D、E5개보수적아결구역,공동조성NAC결구역,C-단함유다개보수적산성안기산위점,구유전록격활공능,동시단백중함유다개사안산(S)、소안산(T)화락안산(Y)린산화위점；비생물역경협박상관NAC단백주요친수구역위우A、C、D아역,대다정위우세포핵,개별정위우세포질혹선립체,이급결구칙이α-라선화β-절첩편위주；의남개RD26화ANAC삼급결구상적일치성암시료공능상적상사.
