中国肺癌杂志
中國肺癌雜誌
중국폐암잡지
CHINESE JOURNAL OF LUNG CANCER
2010年
2期
94-97
,共4页
滑峰%万海粟%梅朝蓉%郑德杰%孙琳琳%陈军%刘红雨%周清华
滑峰%萬海粟%梅朝蓉%鄭德傑%孫琳琳%陳軍%劉紅雨%週清華
활봉%만해속%매조용%정덕걸%손림림%진군%류홍우%주청화
细胞色素P450代谢酶2A13%单核苷酸多态性%同源序列
細胞色素P450代謝酶2A13%單覈苷痠多態性%同源序列
세포색소P450대사매2A13%단핵감산다태성%동원서렬
背景与目的 已有研究表明:细胞色素P450酶2A13(cytochrome P450 2A13,CYP2A13)在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与疾病关联中起重要作用.细胞色素P450酶是一组同工酶,基因序列间有高度的同源性,可能对SNP分析产生影响.本研究初步探讨同源序列对CYP2A13基因SNP研究的影响.方法 应用Taqman探针检测573例人群rs8192789位点的分布,采用BLAST方法分析引物结合序列.对60例样本的CYP2A13序列进行测序,进一步进行了TA克隆测序,应用BLAST方法分析了克隆测序结果.结果 rs8192789位点在573例人群中只有3例为TT纯合型,其余均为CT杂合型,BLAST分析为同源序列导致.60例人群CYP2A13部分序列测序结果完全一致,有大量套峰,101氨基酸位点处没有dbSNP数据库中报道的SNP位点.克隆测序为247 bp、235 bp两个片段.结论 CYP2A13的同源序列对SNP研究造成了干扰,部分SNP位点可能是不存在的.
揹景與目的 已有研究錶明:細胞色素P450酶2A13(cytochrome P450 2A13,CYP2A13)在單覈苷痠多態性(single nucleotide polymorphisms,SNP)與疾病關聯中起重要作用.細胞色素P450酶是一組同工酶,基因序列間有高度的同源性,可能對SNP分析產生影響.本研究初步探討同源序列對CYP2A13基因SNP研究的影響.方法 應用Taqman探針檢測573例人群rs8192789位點的分佈,採用BLAST方法分析引物結閤序列.對60例樣本的CYP2A13序列進行測序,進一步進行瞭TA剋隆測序,應用BLAST方法分析瞭剋隆測序結果.結果 rs8192789位點在573例人群中隻有3例為TT純閤型,其餘均為CT雜閤型,BLAST分析為同源序列導緻.60例人群CYP2A13部分序列測序結果完全一緻,有大量套峰,101氨基痠位點處沒有dbSNP數據庫中報道的SNP位點.剋隆測序為247 bp、235 bp兩箇片段.結論 CYP2A13的同源序列對SNP研究造成瞭榦擾,部分SNP位點可能是不存在的.
배경여목적 이유연구표명:세포색소P450매2A13(cytochrome P450 2A13,CYP2A13)재단핵감산다태성(single nucleotide polymorphisms,SNP)여질병관련중기중요작용.세포색소P450매시일조동공매,기인서렬간유고도적동원성,가능대SNP분석산생영향.본연구초보탐토동원서렬대CYP2A13기인SNP연구적영향.방법 응용Taqman탐침검측573례인군rs8192789위점적분포,채용BLAST방법분석인물결합서렬.대60례양본적CYP2A13서렬진행측서,진일보진행료TA극륭측서,응용BLAST방법분석료극륭측서결과.결과 rs8192789위점재573례인군중지유3례위TT순합형,기여균위CT잡합형,BLAST분석위동원서렬도치.60례인군CYP2A13부분서렬측서결과완전일치,유대량투봉,101안기산위점처몰유dbSNP수거고중보도적SNP위점.극륭측서위247 bp、235 bp량개편단.결론 CYP2A13적동원서렬대SNP연구조성료간우,부분SNP위점가능시불존재적.
