遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2012年
8期
950-968
,共19页
哺乳动物转录因子%DNA结合谱%DNA微阵列芯片%高通量DNA测序
哺乳動物轉錄因子%DNA結閤譜%DNA微陣列芯片%高通量DNA測序
포유동물전록인자%DNA결합보%DNA미진렬심편%고통량DNA측서
基因差异表达是生物发育和对刺激作出应答的分子基础,转录因子在这种基因差异表达中发挥着重要的调控作用.因此,要弄清楚转录因子调控基因差异表达的机理,就必须鉴定出它们全部的靶基因并构建其操纵的转录调控网络.对基因组DNA的序列特异性结合是转录因子调控基因转录的关键环节.因此,要鉴定转录因子的靶基因,就必须从它们与DNA相互作用的分子水平,鉴定它们能够识别并结合的全部DNA序列,即转录因子DNA结合谱.近年来随着DNA微阵列芯片和高通量DNA测序技术的产生和快速发展,出现了建立转录因子体内及体外DNA结合谱的一系列革命性的新技术,对该领域的研究带来重大影响.这些新技术主要包括建立转录因子体内DNA结合谱的染色质免疫沉淀-芯片技术(ChIP-chip)和染色质免疫沉淀-测序技术(ChIP-Seq),以及建立转录因子体外DNA结合谱的双链DNA微阵列芯片技术(dsDNA microarray),指数富集配体系统进化-系列分析基因表达技术(SELEX-SAGE)、结合-n-测序技术(Bind-n-Seq)、多重大规模并行SELEX技术(MMP-SELEX)、凝胶迁移实验-测序技术(EMSA-Seq)和高通量测序-荧光配体互作图谱分析技术(HiTS-FLIP).文章将对这些新技术做一综述.
基因差異錶達是生物髮育和對刺激作齣應答的分子基礎,轉錄因子在這種基因差異錶達中髮揮著重要的調控作用.因此,要弄清楚轉錄因子調控基因差異錶達的機理,就必鬚鑒定齣它們全部的靶基因併構建其操縱的轉錄調控網絡.對基因組DNA的序列特異性結閤是轉錄因子調控基因轉錄的關鍵環節.因此,要鑒定轉錄因子的靶基因,就必鬚從它們與DNA相互作用的分子水平,鑒定它們能夠識彆併結閤的全部DNA序列,即轉錄因子DNA結閤譜.近年來隨著DNA微陣列芯片和高通量DNA測序技術的產生和快速髮展,齣現瞭建立轉錄因子體內及體外DNA結閤譜的一繫列革命性的新技術,對該領域的研究帶來重大影響.這些新技術主要包括建立轉錄因子體內DNA結閤譜的染色質免疫沉澱-芯片技術(ChIP-chip)和染色質免疫沉澱-測序技術(ChIP-Seq),以及建立轉錄因子體外DNA結閤譜的雙鏈DNA微陣列芯片技術(dsDNA microarray),指數富集配體繫統進化-繫列分析基因錶達技術(SELEX-SAGE)、結閤-n-測序技術(Bind-n-Seq)、多重大規模併行SELEX技術(MMP-SELEX)、凝膠遷移實驗-測序技術(EMSA-Seq)和高通量測序-熒光配體互作圖譜分析技術(HiTS-FLIP).文章將對這些新技術做一綜述.
기인차이표체시생물발육화대자격작출응답적분자기출,전록인자재저충기인차이표체중발휘착중요적조공작용.인차,요롱청초전록인자조공기인차이표체적궤리,취필수감정출타문전부적파기인병구건기조종적전록조공망락.대기인조DNA적서렬특이성결합시전록인자조공기인전록적관건배절.인차,요감정전록인자적파기인,취필수종타문여DNA상호작용적분자수평,감정타문능구식별병결합적전부DNA서렬,즉전록인자DNA결합보.근년래수착DNA미진렬심편화고통량DNA측서기술적산생화쾌속발전,출현료건립전록인자체내급체외DNA결합보적일계렬혁명성적신기술,대해영역적연구대래중대영향.저사신기술주요포괄건립전록인자체내DNA결합보적염색질면역침정-심편기술(ChIP-chip)화염색질면역침정-측서기술(ChIP-Seq),이급건립전록인자체외DNA결합보적쌍련DNA미진렬심편기술(dsDNA microarray),지수부집배체계통진화-계렬분석기인표체기술(SELEX-SAGE)、결합-n-측서기술(Bind-n-Seq)、다중대규모병행SELEX기술(MMP-SELEX)、응효천이실험-측서기술(EMSA-Seq)화고통량측서-형광배체호작도보분석기술(HiTS-FLIP).문장장대저사신기술주일종술.
