科学通报
科學通報
과학통보
CHINESE SCIENCE BULLETIN
2003年
23期
2451-2546
,共96页
刘红%彭俊平%杨剑%孙立连%陈淑霞%金奇
劉紅%彭俊平%楊劍%孫立連%陳淑霞%金奇
류홍%팽준평%양검%손립련%진숙하%금기
志贺氏菌属%大肠杆菌K-12%全基因组微阵列%骨架序列
誌賀氏菌屬%大腸桿菌K-12%全基因組微陣列%骨架序列
지하씨균속%대장간균K-12%전기인조미진렬%골가서렬
不同原核生物在基因组组成上的差异是其生物学性状差异的基础. 然而,进化中亲缘关系较近的菌群, 其基因组除了含有群或株特异的基因外, 还含有反映它们起源和进化痕迹的"共有骨架"结构, 而这些"共有骨架"恰恰是它们基本生存能力和共有生物学性状的基础. 志贺氏菌在起源和进化上与大肠杆菌极为密切, 目前倾向于将二者划为同一个种. 利用大肠杆菌K-12全基因组及Sf301特异性ORFs的芯片研究了志贺氏菌4个群间的基因组组成. 结果显示, 分别有16% ～ 22% K-12的ORFs序列没有在志贺氏菌的基因组中被检测出, 而志贺氏菌的基因组中包含至少2800个保守的ORFs, 组成了其共有的"共有骨架". 进一步分析提示, 这些"共有骨架"是维持肠道细菌正常生命生理活动所必需的基本组成. 此外, 只有20%的Sf301特异性ORFs同时存在于其他3个菌株中, 揭示了各菌株间基因组的异质性和菌属内的遗传多样性.
不同原覈生物在基因組組成上的差異是其生物學性狀差異的基礎. 然而,進化中親緣關繫較近的菌群, 其基因組除瞭含有群或株特異的基因外, 還含有反映它們起源和進化痕跡的"共有骨架"結構, 而這些"共有骨架"恰恰是它們基本生存能力和共有生物學性狀的基礎. 誌賀氏菌在起源和進化上與大腸桿菌極為密切, 目前傾嚮于將二者劃為同一箇種. 利用大腸桿菌K-12全基因組及Sf301特異性ORFs的芯片研究瞭誌賀氏菌4箇群間的基因組組成. 結果顯示, 分彆有16% ～ 22% K-12的ORFs序列沒有在誌賀氏菌的基因組中被檢測齣, 而誌賀氏菌的基因組中包含至少2800箇保守的ORFs, 組成瞭其共有的"共有骨架". 進一步分析提示, 這些"共有骨架"是維持腸道細菌正常生命生理活動所必需的基本組成. 此外, 隻有20%的Sf301特異性ORFs同時存在于其他3箇菌株中, 揭示瞭各菌株間基因組的異質性和菌屬內的遺傳多樣性.
불동원핵생물재기인조조성상적차이시기생물학성상차이적기출. 연이,진화중친연관계교근적균군, 기기인조제료함유군혹주특이적기인외, 환함유반영타문기원화진화흔적적"공유골가"결구, 이저사"공유골가"흡흡시타문기본생존능력화공유생물학성상적기출. 지하씨균재기원화진화상여대장간균겁위밀절, 목전경향우장이자화위동일개충. 이용대장간균K-12전기인조급Sf301특이성ORFs적심편연구료지하씨균4개군간적기인조조성. 결과현시, 분별유16% ～ 22% K-12적ORFs서렬몰유재지하씨균적기인조중피검측출, 이지하씨균적기인조중포함지소2800개보수적ORFs, 조성료기공유적"공유골가". 진일보분석제시, 저사"공유골가"시유지장도세균정상생명생리활동소필수적기본조성. 차외, 지유20%적Sf301특이성ORFs동시존재우기타3개균주중, 게시료각균주간기인조적이질성화균속내적유전다양성.
