南方水产
南方水產
남방수산
SOUTH CHINA FISHERIES SCIENCE
2009年
3期
46-52
,共7页
毕潇潇%高天翔%肖永双%李永振
畢瀟瀟%高天翔%肖永雙%李永振
필소소%고천상%초영쌍%리영진
鳕鱼%16SrRNA基因%COI基因%Cytb基因%序列分析
鱈魚%16SrRNA基因%COI基因%Cytb基因%序列分析
설어%16SrRNA기인%COI기인%Cytb기인%서렬분석
对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cyt b)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异.通过PCR扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539 bp(16S rRNA)、601 bp(COI)和385 bp(Cyt b),其基因片段的A+T含量都较高.4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为Cyt b＞ COI ＞16S rRNA.Cyt b 基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Mio-cene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(Pliocene).根据遗传距离构建的NJ系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远.
對狹鱈(Theragra chalcogramma)、太平洋鱈(Gadus macrocephalus)、藍鱈(Micromesistius poutassou)和遠東寬突鱈(Eleginus gracilis)4種不同屬鱈魚的線粒體16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和細胞色素b(Cyt b)基因片段序列進行瞭測定,分析比較瞭不同鱈魚種間的序列差異.通過PCR擴增和序列測定,得到4種鱈魚線粒體3箇基因片段的總長度分彆為539 bp(16S rRNA)、601 bp(COI)和385 bp(Cyt b),其基因片段的A+T含量都較高.4種鱈魚種內箇體間序列變異較小,3箇基因片段的覈苷痠替代速率依次為Cyt b＞ COI ＞16S rRNA.Cyt b 基因片段序列的分析結果顯示太平洋鱈和狹鱈間分歧時間約為219萬年,髮生于中新世(Mio-cene);寬突鱈與藍鱈間分歧時間約為653萬年,髮生在上新世(Pliocene).根據遺傳距離構建的NJ繫統樹錶明,狹鱈與太平洋鱈的親緣關繫較近,與藍鱈的親緣關繫較遠.
대협설(Theragra chalcogramma)、태평양설(Gadus macrocephalus)、람설(Micromesistius poutassou)화원동관돌설(Eleginus gracilis)4충불동속설어적선립체16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)화세포색소b(Cyt b)기인편단서렬진행료측정,분석비교료불동설어충간적서렬차이.통과PCR확증화서렬측정,득도4충설어선립체3개기인편단적총장도분별위539 bp(16S rRNA)、601 bp(COI)화385 bp(Cyt b),기기인편단적A+T함량도교고.4충설어충내개체간서렬변이교소,3개기인편단적핵감산체대속솔의차위Cyt b＞ COI ＞16S rRNA.Cyt b 기인편단서렬적분석결과현시태평양설화협설간분기시간약위219만년,발생우중신세(Mio-cene);관돌설여람설간분기시간약위653만년,발생재상신세(Pliocene).근거유전거리구건적NJ계통수표명,협설여태평양설적친연관계교근,여람설적친연관계교원.
