上海大学学报（自然科学版）
上海大學學報（自然科學版）
상해대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE EDITION)
2006年
6期
593-598
,共6页
刘阳%张冬宁%邵建林%沈称意%汤正诠%王翼飞
劉暘%張鼕寧%邵建林%瀋稱意%湯正詮%王翼飛
류양%장동저%소건림%침칭의%탕정전%왕익비
蛋白质相互作用位点%支持向量机%剖面%可及表面积
蛋白質相互作用位點%支持嚮量機%剖麵%可及錶麵積
단백질상호작용위점%지지향량궤%부면%가급표면적
蛋白质相互作用位点的预测对于突变设计和蛋白质相互作用网络的重构都是至关重要的.由于实验确定的蛋白质复合物和蛋白质配体复合物的结构依然相当少,预测蛋白质相互作用位点的计算方法就显得十分重要.该文提出了一种以支持向量机为分类器,以邻近残基的序列剖面和可及表面积为输入数据来预测蛋白质相互作用位点的方法.计算结果显示,界面残基和非界面残基被识别的准确率为75.12%,假阳性率为28.04%.与输入数据仅有序列剖面的方法相比,界面残基和非界面残基被识别的准确率提高了4.34%,假阳性率降低了4.63%.
蛋白質相互作用位點的預測對于突變設計和蛋白質相互作用網絡的重構都是至關重要的.由于實驗確定的蛋白質複閤物和蛋白質配體複閤物的結構依然相噹少,預測蛋白質相互作用位點的計算方法就顯得十分重要.該文提齣瞭一種以支持嚮量機為分類器,以鄰近殘基的序列剖麵和可及錶麵積為輸入數據來預測蛋白質相互作用位點的方法.計算結果顯示,界麵殘基和非界麵殘基被識彆的準確率為75.12%,假暘性率為28.04%.與輸入數據僅有序列剖麵的方法相比,界麵殘基和非界麵殘基被識彆的準確率提高瞭4.34%,假暘性率降低瞭4.63%.
단백질상호작용위점적예측대우돌변설계화단백질상호작용망락적중구도시지관중요적.유우실험학정적단백질복합물화단백질배체복합물적결구의연상당소,예측단백질상호작용위점적계산방법취현득십분중요.해문제출료일충이지지향량궤위분류기,이린근잔기적서렬부면화가급표면적위수입수거래예측단백질상호작용위점적방법.계산결과현시,계면잔기화비계면잔기피식별적준학솔위75.12%,가양성솔위28.04%.여수입수거부유서렬부면적방법상비,계면잔기화비계면잔기피식별적준학솔제고료4.34%,가양성솔강저료4.63%.
