遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2008年
6期
687-696
,共10页
microRNA%计算发现%同源搜索%比较基因组学%作用靶标%机器学习
microRNA%計算髮現%同源搜索%比較基因組學%作用靶標%機器學習
microRNA%계산발현%동원수색%비교기인조학%작용파표%궤기학습
microRNA(miRNA)是近几年发现的一类长度为-21 nt的内源非编码小RNA,在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能.它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径.由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影响,而计算发现可以弥补其不足,因此miRNA的计算发现方法研究受到了广泛的重视.文章对近几年计算发现miRNA的研究进展进行了综述,根据计算发现方法的本质,将计算发现方法归纳为5类,分别是同源片段搜索方法、基于比较基因组学的预测方法、基于序列和结构特征打分的预测方法、结合作用靶标的预测方法和基于机器学习的预测方法,并对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,最后探讨了进一步的发展方向.
microRNA(miRNA)是近幾年髮現的一類長度為-21 nt的內源非編碼小RNA,在植物和動物中髮揮著重要而廣汎的調控功能.它的髮現主要有cDNA剋隆測序和計算髮現兩條途徑.由于cDNA剋隆測序方法受miRNA錶達的時間和組織特異性以及錶達水平的影響,而計算髮現可以瀰補其不足,因此miRNA的計算髮現方法研究受到瞭廣汎的重視.文章對近幾年計算髮現miRNA的研究進展進行瞭綜述,根據計算髮現方法的本質,將計算髮現方法歸納為5類,分彆是同源片段搜索方法、基于比較基因組學的預測方法、基于序列和結構特徵打分的預測方法、結閤作用靶標的預測方法和基于機器學習的預測方法,併對各類方法的原理、覈心思想、優點和跼限性進行瞭分析,最後探討瞭進一步的髮展方嚮.
microRNA(miRNA)시근궤년발현적일류장도위-21 nt적내원비편마소RNA,재식물화동물중발휘착중요이엄범적조공공능.타적발현주요유cDNA극륭측서화계산발현량조도경.유우cDNA극륭측서방법수miRNA표체적시간화조직특이성이급표체수평적영향,이계산발현가이미보기불족,인차miRNA적계산발현방법연구수도료엄범적중시.문장대근궤년계산발현miRNA적연구진전진행료종술,근거계산발현방법적본질,장계산발현방법귀납위5류,분별시동원편단수색방법、기우비교기인조학적예측방법、기우서렬화결구특정타분적예측방법、결합작용파표적예측방법화기우궤기학습적예측방법,병대각류방법적원리、핵심사상、우점화국한성진행료분석,최후탐토료진일보적발전방향.
