中国科学院研究生院学报
中國科學院研究生院學報
중국과학원연구생원학보
JOURNAL OF THE GRADUATE SCHOOL OF THE CHINESE ACADEMY OF SCIENCES
2009年
1期
58-64
,共7页
蛋白质酪氨酸磷酸酯酶1B%分子动力学%结合自由能%能量分解%MM/GBSA
蛋白質酪氨痠燐痠酯酶1B%分子動力學%結閤自由能%能量分解%MM/GBSA
단백질락안산린산지매1B%분자동역학%결합자유능%능량분해%MM/GBSA
作为二型糖尿病的潜在治疗药物,蛋白质酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)的抑制剂研究一直备受关注,而其中一种二齿类抑制剂由于其普遍较高的选择性和活性,又是抑制剂的研究重点和热点,采用分子动力学方法取样,MM/GBSA方法计算了1个二齿类PTP1B抑制剂与PTPlB及其2个同家族酶TCPTP和SHP-2的结合自由能,得到了与实验活性值相符的结果.同时基于MM/GBSA的能量分解计算表明,抑制剂与,PTP1B第2位点附近的2个残基ARG24和ARG254有很强的相互作用,与其他2个酶第2位点的相互作用则有所减弱,尤其是SHP-2,几乎没有实质性相互作用,这应该是抑制剂产生选择性的关键,同时活性位点附近的残基PHE182也与抑制剂分子有很强的相互作用,相比‘TCPTP也有很大优势,希望这些信息在进一步提升PTP1B抑制剂的选择性和活性方面提供帮助.
作為二型糖尿病的潛在治療藥物,蛋白質酪氨痠燐痠酯酶1B(PTP1B)的抑製劑研究一直備受關註,而其中一種二齒類抑製劑由于其普遍較高的選擇性和活性,又是抑製劑的研究重點和熱點,採用分子動力學方法取樣,MM/GBSA方法計算瞭1箇二齒類PTP1B抑製劑與PTPlB及其2箇同傢族酶TCPTP和SHP-2的結閤自由能,得到瞭與實驗活性值相符的結果.同時基于MM/GBSA的能量分解計算錶明,抑製劑與,PTP1B第2位點附近的2箇殘基ARG24和ARG254有很彊的相互作用,與其他2箇酶第2位點的相互作用則有所減弱,尤其是SHP-2,幾乎沒有實質性相互作用,這應該是抑製劑產生選擇性的關鍵,同時活性位點附近的殘基PHE182也與抑製劑分子有很彊的相互作用,相比‘TCPTP也有很大優勢,希望這些信息在進一步提升PTP1B抑製劑的選擇性和活性方麵提供幫助.
작위이형당뇨병적잠재치료약물,단백질락안산린산지매1B(PTP1B)적억제제연구일직비수관주,이기중일충이치류억제제유우기보편교고적선택성화활성,우시억제제적연구중점화열점,채용분자동역학방법취양,MM/GBSA방법계산료1개이치류PTP1B억제제여PTPlB급기2개동가족매TCPTP화SHP-2적결합자유능,득도료여실험활성치상부적결과.동시기우MM/GBSA적능량분해계산표명,억제제여,PTP1B제2위점부근적2개잔기ARG24화ARG254유흔강적상호작용,여기타2개매제2위점적상호작용칙유소감약,우기시SHP-2,궤호몰유실질성상호작용,저응해시억제제산생선택성적관건,동시활성위점부근적잔기PHE182야여억제제분자유흔강적상호작용,상비‘TCPTP야유흔대우세,희망저사신식재진일보제승PTP1B억제제적선택성화활성방면제공방조.
