遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2010年
4期
360-368
,共9页
李西雷%汪桂玲%李家乐%袁一鸣
李西雷%汪桂玲%李傢樂%袁一鳴
리서뢰%왕계령%리가악%원일명
三角帆蚌%GPX基因%RACE%编码蛋白
三角帆蚌%GPX基因%RACE%編碼蛋白
삼각범방%GPX기인%RACE%편마단백
根据本实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列, 利用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase, GPX)基因cDNA全序列.序列分析表明, 该基因cDNA序列全长1286 bp, 包括5'端非翻译区(Untranslated Region) 39 bp、3'端非翻译区659 bp和开放阅读框(Open reading frame, ORF)588bp, 共编码195个氨基酸, 分子量约为22.2 kDa, 理论等电点为8.44, 属于含硒类GPX.该氨基酸序列具有GPX所有亚型中均高度保守的3个环状结构, 对酶的三级结构起稳定作用.在线分析结果表明: GPX的氨基酸序列不存在明显的疏水区, 也不存在信号肽序列.氨基酸相似性对比结果显示, 三角帆蚌GPX氨基酸序列与脊椎动物GPX-2及GPX-1的序列相似度较高, 为73.1%-80.8%, 与其他型GPX相似度较小, 相似度低于60%.构建的系统进化树显示三角帆蚌GPX与其他几种鱼类GPX聚为一类, 与其他已发表的几种软体动物GPX相距较远, 推测本实验克隆的三角帆蚌GPX基因和已发表的软体动物不属于同一种GPX类型.
根據本實驗室構建的三角帆蚌cDNA文庫中已標註的EST序列, 利用cDNA末耑快速擴增法(RACE)剋隆瞭三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)穀胱甘肽過氧化物酶(Glutathione peroxidase, GPX)基因cDNA全序列.序列分析錶明, 該基因cDNA序列全長1286 bp, 包括5'耑非翻譯區(Untranslated Region) 39 bp、3'耑非翻譯區659 bp和開放閱讀框(Open reading frame, ORF)588bp, 共編碼195箇氨基痠, 分子量約為22.2 kDa, 理論等電點為8.44, 屬于含硒類GPX.該氨基痠序列具有GPX所有亞型中均高度保守的3箇環狀結構, 對酶的三級結構起穩定作用.在線分析結果錶明: GPX的氨基痠序列不存在明顯的疏水區, 也不存在信號肽序列.氨基痠相似性對比結果顯示, 三角帆蚌GPX氨基痠序列與脊椎動物GPX-2及GPX-1的序列相似度較高, 為73.1%-80.8%, 與其他型GPX相似度較小, 相似度低于60%.構建的繫統進化樹顯示三角帆蚌GPX與其他幾種魚類GPX聚為一類, 與其他已髮錶的幾種軟體動物GPX相距較遠, 推測本實驗剋隆的三角帆蚌GPX基因和已髮錶的軟體動物不屬于同一種GPX類型.
근거본실험실구건적삼각범방cDNA문고중이표주적EST서렬, 이용cDNA말단쾌속확증법(RACE)극륭료삼각범방(Hyriopsis cumingii)곡광감태과양화물매(Glutathione peroxidase, GPX)기인cDNA전서렬.서렬분석표명, 해기인cDNA서렬전장1286 bp, 포괄5'단비번역구(Untranslated Region) 39 bp、3'단비번역구659 bp화개방열독광(Open reading frame, ORF)588bp, 공편마195개안기산, 분자량약위22.2 kDa, 이론등전점위8.44, 속우함서류GPX.해안기산서렬구유GPX소유아형중균고도보수적3개배상결구, 대매적삼급결구기은정작용.재선분석결과표명: GPX적안기산서렬불존재명현적소수구, 야불존재신호태서렬.안기산상사성대비결과현시, 삼각범방GPX안기산서렬여척추동물GPX-2급GPX-1적서렬상사도교고, 위73.1%-80.8%, 여기타형GPX상사도교소, 상사도저우60%.구건적계통진화수현시삼각범방GPX여기타궤충어류GPX취위일류, 여기타이발표적궤충연체동물GPX상거교원, 추측본실험극륭적삼각범방GPX기인화이발표적연체동물불속우동일충GPX류형.
