热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2009年
2期
192-197
,共6页
阙友雄%许莉萍%林剑伟%张木清%陈如凯
闕友雄%許莉萍%林劍偉%張木清%陳如凱
궐우웅%허리평%림검위%장목청%진여개
班茅%保守区域%抗病基因同源序列%简并引物
班茅%保守區域%抗病基因同源序列%簡併引物
반모%보수구역%항병기인동원서렬%간병인물
根据已知NBS-LRR抗病基因[含有核苷酸结合位点(NBS)和富亮氨酸重复(LRR)的胞内受体蛋白基因1NBS结构域蛋白质的保守序列,设计简并引物,对斑茅基因组进行体外扩增,获得了对应区段的DNA片段,回收、克隆这些特异片段,测序分析,共获得8个片段序列.序列分析发现其中7个编号分别为RGA-Q1、RGA-Q2、RGA-Q3、RGA-Q4、RGA-Q5、RGA-Q6和RGA-Q7的片段推导的氨基酸序列均具有典型的NBS结构域,即Ploop(GGVGKTr)、Kinase-2a(VLDDVW)、Kinase-3a(GSR/KILVTTR)及疏水结构域HD(hydrophobic domain).它们在NCBI上的登录号为EU685828、EU685829、EU685830、EU685831、EU685832、EU685833和EU685834.这些抗病基因同源片段(RGA)与已经克隆的N、L6、RPS2和胧等11个抗病基因在氨基酸水平上的同源性为2.3%~39.8%.可进一步用作斑茅抗病候选基因的分子筛选及遗传图谱的构建.
根據已知NBS-LRR抗病基因[含有覈苷痠結閤位點(NBS)和富亮氨痠重複(LRR)的胞內受體蛋白基因1NBS結構域蛋白質的保守序列,設計簡併引物,對斑茅基因組進行體外擴增,穫得瞭對應區段的DNA片段,迴收、剋隆這些特異片段,測序分析,共穫得8箇片段序列.序列分析髮現其中7箇編號分彆為RGA-Q1、RGA-Q2、RGA-Q3、RGA-Q4、RGA-Q5、RGA-Q6和RGA-Q7的片段推導的氨基痠序列均具有典型的NBS結構域,即Ploop(GGVGKTr)、Kinase-2a(VLDDVW)、Kinase-3a(GSR/KILVTTR)及疏水結構域HD(hydrophobic domain).它們在NCBI上的登錄號為EU685828、EU685829、EU685830、EU685831、EU685832、EU685833和EU685834.這些抗病基因同源片段(RGA)與已經剋隆的N、L6、RPS2和矓等11箇抗病基因在氨基痠水平上的同源性為2.3%~39.8%.可進一步用作斑茅抗病候選基因的分子篩選及遺傳圖譜的構建.
근거이지NBS-LRR항병기인[함유핵감산결합위점(NBS)화부량안산중복(LRR)적포내수체단백기인1NBS결구역단백질적보수서렬,설계간병인물,대반모기인조진행체외확증,획득료대응구단적DNA편단,회수、극륭저사특이편단,측서분석,공획득8개편단서렬.서렬분석발현기중7개편호분별위RGA-Q1、RGA-Q2、RGA-Q3、RGA-Q4、RGA-Q5、RGA-Q6화RGA-Q7적편단추도적안기산서렬균구유전형적NBS결구역,즉Ploop(GGVGKTr)、Kinase-2a(VLDDVW)、Kinase-3a(GSR/KILVTTR)급소수결구역HD(hydrophobic domain).타문재NCBI상적등록호위EU685828、EU685829、EU685830、EU685831、EU685832、EU685833화EU685834.저사항병기인동원편단(RGA)여이경극륭적N、L6、RPS2화롱등11개항병기인재안기산수평상적동원성위2.3%~39.8%.가진일보용작반모항병후선기인적분자사선급유전도보적구건.