生物技术通讯
生物技術通訊
생물기술통신
LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
2012年
4期
527-531
,共5页
刘文%蒋世云%李强%张夏辉%催晓举
劉文%蔣世雲%李彊%張夏輝%催曉舉
류문%장세운%리강%장하휘%최효거
5-脂氧合酶%酚类抑制剂%抗炎%分子对接%结构活性关系
5-脂氧閤酶%酚類抑製劑%抗炎%分子對接%結構活性關繫
5-지양합매%분류억제제%항염%분자대접%결구활성관계
目的:研究抗5-脂氧合酶酚类抑制剂的结构活性关系及作用机制.方法:构建7个抗5-脂氧合酶阳性酚类抑制剂分子库,利用Autodoek 4.2和iGEMDOCK 2.1软件包对受体与抑制剂进行模拟对接研究并计算结合自由能.结果:用Autodock 4.2、iGEMDOCK 2.1计算得到的结合自由能与抑制剂的抑制活性之间都存在良好的相关性,它们的决定系数(R2)依次为0.85664和0.78441,标准误差(SD)分别为0.43092和5.32335,P值分别为0.00279和0.00798;配体与受体之间形成的氢键在决定配体在受体活性部位的构象及定位中起重要作用,但两者结合的主要驱动力为范德华作用力；具有碳氧双键及与该双键共轭的碳碳双键的多环酚类化合物有较强的抗5-脂氧合酶活性.结论:Autodock 4.2比iGEMDOCK 2.1预测抗5-脂氧合酶酚类抑制剂的能力强；具有碳氧双键及与该双键共轭的碳碳双键的多环酚类化合物有较强的抗5-脂氧合酶活性.
目的:研究抗5-脂氧閤酶酚類抑製劑的結構活性關繫及作用機製.方法:構建7箇抗5-脂氧閤酶暘性酚類抑製劑分子庫,利用Autodoek 4.2和iGEMDOCK 2.1軟件包對受體與抑製劑進行模擬對接研究併計算結閤自由能.結果:用Autodock 4.2、iGEMDOCK 2.1計算得到的結閤自由能與抑製劑的抑製活性之間都存在良好的相關性,它們的決定繫數(R2)依次為0.85664和0.78441,標準誤差(SD)分彆為0.43092和5.32335,P值分彆為0.00279和0.00798;配體與受體之間形成的氫鍵在決定配體在受體活性部位的構象及定位中起重要作用,但兩者結閤的主要驅動力為範德華作用力；具有碳氧雙鍵及與該雙鍵共軛的碳碳雙鍵的多環酚類化閤物有較彊的抗5-脂氧閤酶活性.結論:Autodock 4.2比iGEMDOCK 2.1預測抗5-脂氧閤酶酚類抑製劑的能力彊；具有碳氧雙鍵及與該雙鍵共軛的碳碳雙鍵的多環酚類化閤物有較彊的抗5-脂氧閤酶活性.
목적:연구항5-지양합매분류억제제적결구활성관계급작용궤제.방법:구건7개항5-지양합매양성분류억제제분자고,이용Autodoek 4.2화iGEMDOCK 2.1연건포대수체여억제제진행모의대접연구병계산결합자유능.결과:용Autodock 4.2、iGEMDOCK 2.1계산득도적결합자유능여억제제적억제활성지간도존재량호적상관성,타문적결정계수(R2)의차위0.85664화0.78441,표준오차(SD)분별위0.43092화5.32335,P치분별위0.00279화0.00798;배체여수체지간형성적경건재결정배체재수체활성부위적구상급정위중기중요작용,단량자결합적주요구동력위범덕화작용력；구유탄양쌍건급여해쌍건공액적탄탄쌍건적다배분류화합물유교강적항5-지양합매활성.결론:Autodock 4.2비iGEMDOCK 2.1예측항5-지양합매분류억제제적능력강；구유탄양쌍건급여해쌍건공액적탄탄쌍건적다배분류화합물유교강적항5-지양합매활성.
