湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2009年
12期
2931-2935
,共5页
李德军%邓治%陈春柳%陈守才
李德軍%鄧治%陳春柳%陳守纔
리덕군%산치%진춘류%진수재
巴西橡胶树%核糖体蛋白S5%基因克隆%序列分析
巴西橡膠樹%覈糖體蛋白S5%基因剋隆%序列分析
파서상효수%핵당체단백S5%기인극륭%서렬분석
Hevea brasiliensis%ribosomal protein S5%gene cloning%sequence analysis
核糖体蛋白S5是核糖体蛋白家族的重要成员,在核糖体中发挥重要作用.利用本实验室获得的部分序列设计引物,采用3'-RACE技术从巴西橡胶树胶乳中获得一个核糖体蛋白S5基因的完整阅读框,该基因编码209个氨基酸的多肽,含有一个典型的真核生物核糖体蛋白S5结构域.在HbRPS5氨基酸序列中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明HbRPS5属于混合型蛋白.对14个RPS5系统进化分析表明,巴西橡胶树的RPS5基因在进化上具有保守性,与植物类拟南芥的RPS5基因亲缘关系最近,而与人和酵母等亲缘关系相对较远.该基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础.
覈糖體蛋白S5是覈糖體蛋白傢族的重要成員,在覈糖體中髮揮重要作用.利用本實驗室穫得的部分序列設計引物,採用3'-RACE技術從巴西橡膠樹膠乳中穫得一箇覈糖體蛋白S5基因的完整閱讀框,該基因編碼209箇氨基痠的多肽,含有一箇典型的真覈生物覈糖體蛋白S5結構域.在HbRPS5氨基痠序列中沒有預測到跨膜區和信號肽,二級結構分析錶明HbRPS5屬于混閤型蛋白.對14箇RPS5繫統進化分析錶明,巴西橡膠樹的RPS5基因在進化上具有保守性,與植物類擬南芥的RPS5基因親緣關繫最近,而與人和酵母等親緣關繫相對較遠.該基因的剋隆和生物信息學分析為深入研究其功能奠定瞭基礎.
핵당체단백S5시핵당체단백가족적중요성원,재핵당체중발휘중요작용.이용본실험실획득적부분서렬설계인물,채용3'-RACE기술종파서상효수효유중획득일개핵당체단백S5기인적완정열독광,해기인편마209개안기산적다태,함유일개전형적진핵생물핵당체단백S5결구역.재HbRPS5안기산서렬중몰유예측도과막구화신호태,이급결구분석표명HbRPS5속우혼합형단백.대14개RPS5계통진화분석표명,파서상효수적RPS5기인재진화상구유보수성,여식물류의남개적RPS5기인친연관계최근,이여인화효모등친연관계상대교원.해기인적극륭화생물신식학분석위심입연구기공능전정료기출.
The ribosomal protein S5 is the key member of ribosomal protein family,and it plays an important role in the ribosomal proteins.The primers designed based on the known sequences,the gene was cloned with 3'-RACE technique from Hevea brasiliensis latex.The open reading frame encoded 209 amino acids,containing a conserved ribosomal S5 domain,so the gene was named as HbRRS5.No signal peptide and transmembrane structure were predicted within HbRPS5.The result of secondary structure predicted showed that the protein was classified as mixed type.The result of phylogenetic tree indicated that HbRPS5 displayed a high degree of sequence similarity to AtRPS5,but not to animals,such as Homo sapiens,Rattus norveegicus,and 80 on.This paper will be benefit to further analyze the functions of HbRPS5.