微生物与感染
微生物與感染
미생물여감염
JOURNAL OF MICROBES AND INFECTION
2011年
1期
4-10
,共7页
刘莉%马建新%郑毓芳%张仁芳%沈银忠%李莉%陈军%王珍燕%孙富艳%卢洪洲
劉莉%馬建新%鄭毓芳%張仁芳%瀋銀忠%李莉%陳軍%王珍燕%孫富豔%盧洪洲
류리%마건신%정육방%장인방%침은충%리리%진군%왕진연%손부염%로홍주
人类免疫缺陷病毒%基因亚型%重组体%耐药基因突变
人類免疫缺陷病毒%基因亞型%重組體%耐藥基因突變
인류면역결함병독%기인아형%중조체%내약기인돌변
本文通过对未经抗病毒治疗患者的人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株进行检测,了解上海地区HIV-1的亚型分布及原发耐药基因变异现状.对118例未经治疗的HIV感染者标本中HIV蛋白酶全长和部分反转录酶基因进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,经DNA测序后,进行系统进化树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与斯坦福耐药数据库比对,了解耐药突变位点.使用斯坦福REGA HIV亚型分型工具和美国国立生物技术信息中心(NCBI)HIV亚型分析工具分析,获得118例患者的HIV基因序列,基因分型分别为CRF01_AE重组体57例(48.3%)、B亚型36例(30.5%)、CRF07_BC 15例 (12.7%)、CRF08_BC 7例(5.9%)、C亚型2例(1.7%),亚型间或重组体间二重重组体(B/CRF01_AE)1例(0.8%).蛋白酶抑制剂(PI)和反转录酶抑制剂相关的耐药基因突变率达54.2%(64/118),其中2例(1.7%)发生PI耐药,基因突变位点:M46L、Q58E.5例(4.1%)对反转录酶抑制剂产生耐药,其中对核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)和非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)的耐药率分别为3例(2.4%)和5例(4.1%).基因突变位点:NRTI为M41L、D67N、T69I/N/S、K70L、L74V、V75L、V118I、M184V、L210W/F/M/S和T215F;NNRTI为V90I、L100V、K103R/N、V106M/P/I/G、E138G/A、V179E/D/T、Y181C、G190A、H221Y、F227L、K238S和Y318F.结果提示,上海地区HIV毒株以CRF01_AE重组亚型为主,且发现新的重组体,可能出现新重组体流行趋势.PI和反转录酶抑制剂相关的耐药基因突变率较高,且存在高度原发耐药毒株,应加强HIV-1耐药基因变异监测,科学、合理地给予抗病毒治疗.
本文通過對未經抗病毒治療患者的人類免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株進行檢測,瞭解上海地區HIV-1的亞型分佈及原髮耐藥基因變異現狀.對118例未經治療的HIV感染者標本中HIV蛋白酶全長和部分反轉錄酶基因進行反轉錄-聚閤酶鏈反應(RT-PCR)擴增,經DNA測序後,進行繫統進化樹分析和重組分析,以確定HIV-1基因亞型和重組體,併與斯坦福耐藥數據庫比對,瞭解耐藥突變位點.使用斯坦福REGA HIV亞型分型工具和美國國立生物技術信息中心(NCBI)HIV亞型分析工具分析,穫得118例患者的HIV基因序列,基因分型分彆為CRF01_AE重組體57例(48.3%)、B亞型36例(30.5%)、CRF07_BC 15例 (12.7%)、CRF08_BC 7例(5.9%)、C亞型2例(1.7%),亞型間或重組體間二重重組體(B/CRF01_AE)1例(0.8%).蛋白酶抑製劑(PI)和反轉錄酶抑製劑相關的耐藥基因突變率達54.2%(64/118),其中2例(1.7%)髮生PI耐藥,基因突變位點:M46L、Q58E.5例(4.1%)對反轉錄酶抑製劑產生耐藥,其中對覈苷類反轉錄酶抑製劑(NRTI)和非覈苷類反轉錄酶抑製劑(NNRTI)的耐藥率分彆為3例(2.4%)和5例(4.1%).基因突變位點:NRTI為M41L、D67N、T69I/N/S、K70L、L74V、V75L、V118I、M184V、L210W/F/M/S和T215F;NNRTI為V90I、L100V、K103R/N、V106M/P/I/G、E138G/A、V179E/D/T、Y181C、G190A、H221Y、F227L、K238S和Y318F.結果提示,上海地區HIV毒株以CRF01_AE重組亞型為主,且髮現新的重組體,可能齣現新重組體流行趨勢.PI和反轉錄酶抑製劑相關的耐藥基因突變率較高,且存在高度原髮耐藥毒株,應加彊HIV-1耐藥基因變異鑑測,科學、閤理地給予抗病毒治療.
본문통과대미경항병독치료환자적인류면역결함병독1형(HIV-1)독주진행검측,료해상해지구HIV-1적아형분포급원발내약기인변이현상.대118례미경치료적HIV감염자표본중HIV단백매전장화부분반전록매기인진행반전록-취합매련반응(RT-PCR)확증,경DNA측서후,진행계통진화수분석화중조분석,이학정HIV-1기인아형화중조체,병여사탄복내약수거고비대,료해내약돌변위점.사용사탄복REGA HIV아형분형공구화미국국립생물기술신식중심(NCBI)HIV아형분석공구분석,획득118례환자적HIV기인서렬,기인분형분별위CRF01_AE중조체57례(48.3%)、B아형36례(30.5%)、CRF07_BC 15례 (12.7%)、CRF08_BC 7례(5.9%)、C아형2례(1.7%),아형간혹중조체간이중중조체(B/CRF01_AE)1례(0.8%).단백매억제제(PI)화반전록매억제제상관적내약기인돌변솔체54.2%(64/118),기중2례(1.7%)발생PI내약,기인돌변위점:M46L、Q58E.5례(4.1%)대반전록매억제제산생내약,기중대핵감류반전록매억제제(NRTI)화비핵감류반전록매억제제(NNRTI)적내약솔분별위3례(2.4%)화5례(4.1%).기인돌변위점:NRTI위M41L、D67N、T69I/N/S、K70L、L74V、V75L、V118I、M184V、L210W/F/M/S화T215F;NNRTI위V90I、L100V、K103R/N、V106M/P/I/G、E138G/A、V179E/D/T、Y181C、G190A、H221Y、F227L、K238S화Y318F.결과제시,상해지구HIV독주이CRF01_AE중조아형위주,차발현신적중조체,가능출현신중조체류행추세.PI화반전록매억제제상관적내약기인돌변솔교고,차존재고도원발내약독주,응가강HIV-1내약기인변이감측,과학、합리지급여항병독치료.
