计算机工程
計算機工程
계산궤공정
COMPUTER ENGINEERING
2012年
13期
48-50
,共3页
李杰辉%张亮%陈健%南蓬
李傑輝%張亮%陳健%南蓬
리걸휘%장량%진건%남봉
生物活性%生物信息学%并行计算%可扩展性%数据库%Hadoop框架
生物活性%生物信息學%併行計算%可擴展性%數據庫%Hadoop框架
생물활성%생물신식학%병행계산%가확전성%수거고%Hadoop광가
通过药物虚拟筛选,发现在具有生物活性化合物过程中,存在小分子结构相似性比较计算繁杂等问题.为此,结合MapReduce 模型,提出一种基于Hadoop的并行计算模型处理方法,并通过Hadoop工具予以实现.同时根据Hadoop分区算法不均匀、容错功能存在重复计算等问题对该方法进行改进.实验结果表明,该方法平均加速效率达到0.91,具有较好的可靠性和扩展性.
通過藥物虛擬篩選,髮現在具有生物活性化閤物過程中,存在小分子結構相似性比較計算繁雜等問題.為此,結閤MapReduce 模型,提齣一種基于Hadoop的併行計算模型處理方法,併通過Hadoop工具予以實現.同時根據Hadoop分區算法不均勻、容錯功能存在重複計算等問題對該方法進行改進.實驗結果錶明,該方法平均加速效率達到0.91,具有較好的可靠性和擴展性.
통과약물허의사선,발현재구유생물활성화합물과정중,존재소분자결구상사성비교계산번잡등문제.위차,결합MapReduce 모형,제출일충기우Hadoop적병행계산모형처리방법,병통과Hadoop공구여이실현.동시근거Hadoop분구산법불균균、용착공능존재중복계산등문제대해방법진행개진.실험결과표명,해방법평균가속효솔체도0.91,구유교호적가고성화확전성.
